NAME_ID = RLC_TAR1_AF459088-2
CLASSIF = Retrotransposon, LTR, Copia
COMMENT = 5' truncated
TREPACC = TREP1317
ORGANIS = Triticum monococcum
SIZEDNA = 5499
SSOURCE = AF459088
RELDATE = 18-APR-2003
SUBMITT = Jorge Dubcovsky
REFEREN = Yan et al., Mol. Genet. Genomics 268 (4): 488-499 (2002). 
ANN_TSD = 
ANN_LTR = 4473-5499
PROTEIN = PTREP86
>gnl|TREP|TREP1317 Retrotransposon, LTR, Copia, "RLC_TAR1_AF459088-2"; 5' truncated
ATCCAAAAACCTTATTTTAGGCACTTTTCGATTCAGGGCTTTGCTGCTAC
TCTGAAACCGGAAAAATTTACTGGGACGCATTTTAAGCGTTGGCGGACAA
GGACCACCTTGTGGCTCATAGCGATGAATGTGTTTTGGGTTGGTGGTGTG
TCCCTCACATAAACGATTGCTCCTGAATAGGAGAAGGCGTTTAGGGAGGC
AACCACAATCTTTCTGGGAGCAGTTCTGAGTGTGATTGGAGACAAGTTGG
TTGACGCCTATATTCATATGGGCGTTGCCAAAAACTTGTGGGATGCGCTC
GAAGTCAAATTTGGCGCAACTGATGTTAGCAGTGAGCTGTATGCCAGGGA
GCAGTTCCATGATTACAGGATGGTTGATAACCGTTCTGTATTGGACCAGG
CTCATGAGATACAGTGCATTGCTAAGGAGCTGGAGCTCCTGAAGTGTGAG
TTACCGGACAAGTTTGTCGCGGGTTGCATTATTGCAAAACTCCCTCCTAG
TTGGAGGAACTTTGCTACTTCTCTCAAGCACTAATTGAGACGTGAATTCT
CTGTTGAGGATGTCATTGGTCATCTCAGTGTTGAGCAGAACTCGAGAACA
AAGGACTCACACGTGAAAGAGGCAGAGGGTTCTTCTAGCGCCAATGTGGT
GCAGAAGAACTTCCACAAGTTCAAGGGAAAGAACTCTGTCTAACAGAATA
CTACCTTTAAGAAGAAAGGTAAGAAGAAAGACAAAAAGAGAGATGACTTC
TTTACTTGTGGTTCAGATGAACGTTGGGCAAACAAGTGCCCAAACAAGTA
CAAGAAGCCAGCACAGGACTCCAAGTCTGTGAATGTCACTCTGAGTAACA
ATGATGAGGCATCTGGGTATGGTAATATGTTTACCATACTTTCAGTTTGC
CTGTCCACCGATTGGTGGATTGACACTGGGGCCAATATTCATGTGTGTGC
TGATGTGTCTTTGTTTTCTTCCAACTAGGTCGCACGAGATTGTTCCGTCC
TGATGGGGAATGGCTCACATGCTTCTTTTCATGGTGTTGGCATGGTAGAT
CTGAAGTTTACTTCGGGAAAGATCGTGCAACTGAAGAACGTGCAGCATGT
CCCCGCCATAAAGAAGAATCTCGTTAGTGGCTCCCTTCTATGTAAAGAAG
GCTTTAAGTTAGTATTTGAGTCTAACAAAGCAGTCATGTCTCGGTATGGA
CTATTTTCTGGAAAAGGATATGATTGTGGTGGTTTGTTCCGCCTTTCCCT
AGAGGGTTTTTATAATAAAGTCATGAACCAAATTCATTCTAATGTGAACG
AATCTGAGGTTTGGCATTCACGTCCTTGTCACATAAATTTCGGTTGTATG
ACGCGGCTAGCTAAGACGGATTTAATCCCGAGTTTCACTTTAGCCAAAGG
CTCTAAGTGCCATGCGTGTGTGCAAGCTAAGCAACCTCGTAAGCCTCACA
AGCTTGCGAAGGAGAGACACCTGGCACCTCTAGAGCTCATACATTCAGAT
CTCTGTGAGATGAATGGTGTGTTGACTAAACATGGAAATAAATACTTCAT
GACTCTGATTGATGATTCCACTAGATTCTGCTATGTGTATTTGTTAAATA
CTAAGGATGAGGCTCTACACTACTTTAAAATCTATAAGGCTGAAGTTGAG
AACCAACTTGAGAAGAAAATAAAATGAGTCCGGTCTGATCGTGGTGGAGA
GTAATTTTCTAATGAGTTTGATTTATTCTGTGCGGAACATGGTATTATTC
ATGAGAGGACGCCTCCCTACTCACCCCAGTCAAACGGGGTTGCCGAACGG
AAAAACCATACTCTAACTGAGTTGGTTAACGCCATGTTAGATACATCGGG
TTTATCCAAGGCATGGTGGGGGGAGGCTGTATTGACATCTCGTCATGTCC
TGAATAAAGTTCCCATAAAGGATAATGAGACTACTCCCTATGAGCAATGG
GAAAAGAAAAGAACTACACTCTCTTACTTGCGCACTTGGGGCTGTTTGGC
GAAAGTCAATGTGCCGATAATCAAAAAGCGCAAGTTGGGACCAAAGACTG
TGGACTGTGTTTTTCTTGGCCATGCCAAGCATAGCGTTGGCTATAGAGTT
TTAGTGGTGAAAACTGAGGTACCTGACCCGAAGGTCGGTACAATTATAGA
GTCTAGGGATGCTACATTCTTTGAGGATATTTTCCCCATGAGAGATATGC
AAAGCAATTCTAGACTGGAATCTGATGAGACTCCTGAACCTGCTATTCCG
ATGGAATATTATGAACATAAAAGTGATAAGAGTTCCACGGAGGATGATGA
GGAAGCTCTTGTTAGGAGCAAGATACAGAGGACTGTAAAGTCCTTTGGTG
ATGATTTCATTGTGTACCTCGTGGATGATGATACTCTCAGCTCCATTTCA
GAAGCTTATGCATCTCCGGATGCTGACTACTGGAAGGATGCGGTCCGTAG
TGAGATGGATTCCATCTTGGCTAACGGAACATGGGAGATCACTGATCGTC
CTTATGGTTGTCGACCATTATGATGTAAGTGGGTGTTCAAAAAGAAGCTT
ATGCCCAATGGTACTGTTGAAAAGCACAAGGCTAGGCTTGTGGCCAAGGG
TTATACCCAGAAAGAAGAAGAGGATTTCTTTGACACTTATTCACCTGTGG
CTAGACTGACAACCATTCGAGTGTGACTCGCTTTGGCTGCCTCGCATGGT
ATTCTCGTTCATCAGATGGACGTTAAGACGGCTTTCCTTAACGGAGAGCT
AGACGAGGAAATTTACATGCAATAGCCGGATGGCTTTGTAGTAAATGGTC
AGGAAAGAAAGGTGTGTAAGCTAGTGAAATCTTTGTATGGCCTGAAACAA
GCGCCTAAGCAATGGCATGAGAAATTCAACACTACTCTGACATCTACTGG
CTTTGTTGTGAACGAAGCTGAAAAATGTGTATACTATCGCTATGGTGGGG
GCGAAGGATTTATACTGTGTCTGTATGTCGATGACATACTGATATTTGGG
ACCCACCTCAAGGTCATTGAGGAGGTCAAGTCTTTTCTATCTCACAACTT
TGAGATGAAGGACCTGGGTGTGGCTGATGTTATCCTGAACATCAAGCTAC
TAAGGAATCCTGAGGGTGGAATTACACTTTTGCAATCCCACTATGTTGAG
AAGGTTTTGAGCCGTTTTGGATATTCGGACTGCAAACCTTCTGCAACACC
ATATGATCCTAGTGTGCGGATTAGAAAGTTCGAAGGCACGCCTGTAGATC
AATTGAGATATTCTCAAGTGGTTGGTTCACTGATGTACCTAGCATGTGCT
ACTCGTCCTGACATCTCATTTGCTGTGTGCAAACTTAGCCGGTTTGTTTC
CAATTCGGGAGATGTGCACTGGCATGCTGTTGAGCGAGTGATGCGTTATT
TGCAAGGTATTGCGAACTATCGAATTCAGTATTCTAGGTACCCGACGGTA
CTTGAGGGGTATAGTGATTTGAATTGGATATCTGATGCTGATGAGATGAA
AGCCACAAGTGGACATGTCTTCACACTTGGTGGTGGCGCTGTTTCCTGGA
AGTCTTGCAAGGAGACAATCTTAACCAGATCGACTATGGACGCAGAACTC
ACAGTATTAGACACATCATGCGTCGAAGCAGAATGGCTTCAAGAGCTTTT
GATGGATTTGCCGGTGGATGATAAACCAGTGCCGGCTGTCCTTATGAACT
GTGACAATCAAACAGTGATTGCCAAGGCTAAGAGTTCAAAGGACAACATG
AAATCCACAAAGCACATAAGAAGAAGATTGAAATCTATCAGAAAATCAAG
AAACTCCGGAGTAATAGTGTTGGATTACATCTAGACGGCTAAGAATATGG
CAGACCCTTTTACGAAAGGGCTATCACGGATTGTGATAGAAAATGCATCG
AGGGAAATGGGTATGAGACCCACGTAAGTTGCCATGGGGGTAGCCCAACC
TATGTGATCGGAGATACTGTGAATTAGGACCCGGGAAAACAATCCAGTGG
TCAACTGAGGTGAGTATCCTTAATTAACCCACTCCGTTGGAGATGCACAA
TACTGTCAATTCTGTAAGGCACGCTGACTTTTGTCTTAATGTGTTCCAAA
GCTTGTGTAAGCAAGATGCTAACCTACAGAGCATTCTTTGGAGGAAAACA
CACCTATGTGAGCCCGACTGCTGGTCACAGTCTATGAGATTGGGTAATCT
CTAGTAAGCTCATGAGAAGGTACGGAGTATGACTAATAAGCTCCACCCGT
GGGGTTTAGCCTATGGCAGCCATGTATCCGCTAACAATAGGCAAAACTTC
TGCACACCAAACTGACAATTCAAGGCATGGTCCATTGTTCAGTTGTGAAG
AAGTCTAATCCCGTTGCTCTAGGTGGAAGTTCAACTTAACAGTCTCCACT
AAAAATTCTGGTATATCAAACATTGTTTGGAACAGTTGACAAACTTATGT
GCCTCGAGATCTGGTGGGAGATTGTTGGATTATGGATGGGCTTAGGCCCA
TATAAGACACTAATCCCTGGTTAATGTTGAGGCCCATGTATGAGATGGCA
GGTGGTGGGAAGTTTAGTCCCACCTTGCTAGTTGAGGAGAGTGGAGACCC
CTTTATAAGGGTTGCTCTACCACTTGCCATTGGGAGCTTGGGAAGAGGAG
TGGTACACGCGCGCTCCTCCTCCTCCATCGCCCGCCTCGCCACGCCTCGC
CTCATCACGACGCGCGCGCGCCGCGGGTTGCGGGAATGAGCCGAGCCGAA
GCTTATTTTTGCCGCTCAGGAATGAATTAATTAATTGGGGATTAATTAAC
GATTCACTGACATGTGGGCCACTGTCCAAGACGTTGGACTGTGGGCTGAC
TTGCGTTGCCGGGATTCGTCGACTCCCTTGCCGGGGGTGTGACCCTTGGC
GGGAGTGGGCCGACTCAGTCGTGGGCCTTGCCAAGGCCCACGACTTTCTT
CCTTATGGACTACATAAGTAGGCTAGTTCACTTCACTCACTCACTCTCGC
TTGACCTAGCCGTCATCTACTGTTCCTCACTTTGTGCTGCCTCCGGCGAT
CCCATCCCGACGACCGCGTGCACGGCCTGTCGGGAGAGCAGGTGCCTCCG
GAACCCTGTCGTTCGAGATCTTGCCTGAGAGAACGGCAATAAGGTTTTTG
GGGAGCGTCTCGACGCGACTGCTCCCAATCCGTTCGCCTCTGCTTCCACT
ACTTCCTATGCATCAACACCATGGCCGCCGCCGCCGCCGCTAAGAAGATG
GCCACAGACGACGCCGAGGCTGCTGCTGCTGCCGCCGCGTTGGCCTGGCC
AACTGGATGGTATGATCTGTTCAACCCTTGTTTACTCATACTTATGCTAG
CCATATATGTGCTGATCATAGAATGTTTGATTCTATGTTCTGTACGTGCT
AGTATGCTCAGGTATCGCTATGAGATGCATACCTTTTATGCTATGCTTAC
TGTTTACTCGTGGATAAGTCTAATCAGAAAAGTGCTCATATTTCCAACA