NAME_ID = RLC_Rada_AY661558-1
CLASSIF = Retrotransposon, LTR, Copia
COMMENT = degenreated CDS
TREPACC = TREP1536
ORGANIS = Hordeum vulgare 
SIZEDNA = 4935
SSOURCE = AY661558
RELDATE = 01-OCT-2004
SUBMITT = Thomas Wicker
REFEREN = Wicker et al., Plant J. 41: 184-194 (2005)
ANN_TSD = 
ANN_LTR = 
PROTEIN = PTREP98
>gnl|TREP|TREP1536 Retrotransposon, LTR, Copia, "RLC_Rada_AY661558-1"; degenreated CDS
ATGACTTTCATGAAGTACGAGCTTCCGCTGCCGGACCGTGACACAATGTT
TACCCTATGACAAGTGAAGATGCGGGCGTTGTTGACACAGGCCGACTATG
ATGATGCACTGGATAGTTTTTGGGAAGCATATAATTGAGGATTGGACAGC
CGAGGAAAAAAGAAAGGATCGTAAGGCTTTGTCATAAATTCAACTCAATT
TGCATAATAATATTTTGCAGGAAGTTTTGAACGAGAAAACTGCCGCCGCT
CTATGGTTAAAGCTGGAAGGGATTTGCATGCAAAAAGATCTCACCAGCAA
GATGCATCTGAAGCAAAAATTATTCATGCATAGGTTACTCGAGGGAGGTA
ATGTTTTGAATAATATTTTAAAATTTGAAGAGATCATATCTGATCTAGCT
GCAATGAAGGTTAAGTATGAAGAGGAAGATGCTGCTTTAATGTTACTTTG
TTTACTGCCAAGTTCTTATACCAGTTTTCGAGACACCATATTATACAGTC
GTGATACTCTCACGCTTAATGAAGTTTATAAAGCTCTGAACTCTAAGGAG
AAGATGAAATTAATGGTCCCTCATGATGGTTCAAGTTCATCTCAAACCGA
GGGATTATCTGTTCGTTGCAGGACAAAGGAAAATAACTCACATAATGAAA
ACAGAGGCAAAAGTAAAAACGGCCAGAGGGGCCGGTCGCAATCGAGAGAC
AAGAAGAAATCTTGTAGATATTGCAAGAGATACGCGCATGACATCTCAGA
CTATTACAAGTTGCAGAACAAGGAAAAGAAAAACGGTACATATAAACCGA
ACGGTAACAAACAAGGTGAAAATTCTGCTAATGTTGCTCGTGATGATAGT
TCTGATGATGCTCTTGTTGTTATTGTTGGATGTGCTGAGTTGTACTTTTC
ATATGTGCCCGCATAGAGATTGGTTTACTAATTTTGATTCTACTACTCTT
GCTGGTTCCGTTTTGGGTTTTGATAATTCATCATGCGAGATTGAAGGCAT
AGGTTCCGTTTGAATCAAGATGTTTGATGGCACAATCAGAACTTTGACAG
ATGTTCAGTATATTCTGAAGATGAAGAGAAATCTTATCTCTATGAGCGCC
GTTGATGCAAAGGGCTACAAGTATTCAGGTGGAGATAGCGTTTTGAAGGT
CACCAAAGGTTCTCTTATTTGTGATGAAAGGTGACTTAAGTTCGACCAAT
GGTCTTTATTACCTTCGAGGTTCTACTGTTTAAGGTAACAATACTCCAGT
TATTTCAAAGAATTCTGATTGTGATGCTTCTAACCTTTGGCATATGCGTC
TTGCACATATGAGTGAACTTGGTTTGACAGAGTTACATAAGAAAGGTCTC
CTTAAAGGATATGAAACTGGTAAATTGAAATTTTGTGAGCATTGTATCTT
CGACAAGCACAAGAGGGTGAAGTTCAACACTTCAACTCGTACAACTGAAG
GTATTCTTGATTATGTTCAGTCTGTTTCATGTGCACCATCTCGCAAAAGG
TCACTAGGTGGTGCTAGTTACATCTTGACTATTATTGATGATTATTTGAG
AAAAGTTTGGCCTTATTTCTTGAAGCATAAATGACAAGCTTTCTCACTTT
TAAGGAGTGGAAGATTATGATTGAGAGGCAAACTGAAAAAAAGGTAAAAC
TACTTCGCACTGATAATGGTATGGAATTCTGTTCTAACAAATTTGAGAAT
TATTGCAAGTCTGAAGGCATTGTCAGACACTACACCGTTCCTTATACTCC
TCAACAACACTGTGTTTCTAAGAATATGAACATGACCATTATTTCCAGAG
CCCGTTGCATGTTGTCCAATGCAGGTTTGCATAGGCGTTTTTGGGCTGAG
GTCGCTTCAACTGCTTGTTATCTCATTAATCGTTCACCATCTATTCCTCT
TAATAAGAAAACTCCGAATCAGGTATGGTTTGGTTCACCTGTTGATTATT
CACAATTGATAGTTTTTTGTTGCACTGCTTATGCTCATGTTGATAATGGG
AAGTTGGAGCCTATGGCTGTTAAGTGCATCTTTCTTGGTTATAAGTATGG
TGTCAAAGGTTTTAAATTGTGGAATCCTGAAACACAGAAGGTTGTTATTA
GAAGAAATGTTATTTTTAATGAATCTGCTATGTTACATGATGTTTCATCT
ACTAATGTTCCTCTTGAGAGTGAACAACAGCCTACTATTCAGCACCCTAC
TGTTCATGTGGAGCATGTTATTTCAGGTGATACTTCTGATAAGGAAAATA
TTGATGCACATGATGAACTCGCCGTTGATGATGAATATGTCACTCCAAAT
CATCCTATTGTTCCAGCCAGTTGGAACCTCGCACGTGACAGAGTTAGGCG
GGGTACTAATGCACCTAAAAGGTTAATTGAAGAATGCAATATTGTTTCTT
TTGATTTATCTGTCGAAGAAGAAATTGAAGGAAATGTTGATCCTTTTTCA
TATTCTGATACTATTATTTCTAATGATAGTAATAAGTGGATGACCGCTAT
GCACGATGGGATGAAATCACTTGAAAAGAATGACACTTGGGATTTAGTAA
GATTACTAAGAGAGAAGAAACCTATTTGTTCTCTCTCCGGAAAGGCTTGA
ACAAGACTCCTTATGAAATTCTTACTGGTAACAAGCCCAACCTCAAGTCC
TTCACGGTGTCCGGGTGTAAGTGTTTCATTCTCAAGAAAGGTGTTCATTT
GTCTAAATTTGAACCTAGAGCTCAAGAGGGTATATTTGTTGGTAATGCTA
CAAACTCTTGCGGTTACCGTGTCCTCAACACGTCCAATGGGCTCATTGAG
GAGACGTGTAACGTTGAGTTTGATGAAAATAATGGCTCCCAAGTGGAGCA
AAGTGGTCTTTCTGATGTAGGTGATGAAATTCCTCCCCAAGCCATAAGAA
GAATGGGTGTGGGACACTTCCTACCCGAAGGAGAAGGACAATGTTCCACT
CAAGTGGAACCATCACCAATGCAAGACCCACACGCTTCCGAAGAACAAAA
TGAAGGCCCTCAACCCCGTGGACAAGATCACGAGCAAGATCAATCTAATG
ATGATGGTGTTTCATGAAATGATGCCCAAGATAAAGTCCACATCCCCGAG
CAAGCTCAAGATCAAGACCAAATTCAAGATCTAGAGCAAGCTCATGACGG
CGCTCAAGATCATCAAGATGATGCTCCTCAGAATGTTGTCCCTCAACTTT
CCATGGAGGAGATCGTAGAGAGACAAGCCGCCAAGATTGCTGCCAAGCTT
GAACATAAACAACATTTGTTGAAAACGTCTACGGTAGCTTGAAAGAGGGG
TAACCACTCGTAGGCAATTAACAAATTTTGTGAACATCACGCGTTTGTTT
CTTGCATTAAACCCCTCAAGGTACAAGATGCGCTCGAGGACATGGAGTGG
GTTAAAGCCATGCATGATGAAAAACTTCGAGCGCAACAAAGTGTGGCGTT
TGGTGCCAAGACAAAAGGAGGATGACAATGTCATTGGAACCAAATGGATC
CTCAAGAACAAGCAAGATGCAAATGGGGTTGTCATTAGCAACAAGGCAAG
ATTGGTGGCACAAGGCTATTCCCAAGTCGAGGGTATCGACTAAGGTGAAG
CTTTTGCCCCCGTTCCTCATTTTGAATCTATCCTCGTGTTTCTTGTATAT
GCATCTCACCATGATTTCAAATTATATATATGGATGTGAAAATTGCATTT
CTTAATGGTCCGCTTAAGGATTTGGTATATGTCAAGCAACCCCCGGGATT
CGAGGATCCTTAGTTCCCCAATCATGTATACATTCTCAATAAGGCTCTCT
ACGGCCTTAAACAAGCCCCACGTGACGTGCGTGGTATGAGCACCTTACCG
AGATGTTGCAAGACCGTGGGTTTGAAATTGAAAAAATTGATCCCACTCTT
TTTACAAAGATGGTTAAAGGGAACTTGTTCATATGCCAACTATATGTTGA
TGATATTATATTTGGTTCTCCTAACAAAGCTTTTAATGATGATTTTACCA
CACTAATGACCAAATAATTTGAGATGTCAATGATGGGAAAGTTGAAGTAC
TTCCTTGGATTCGAAGTCAAGTAACAAAGTCAAGGAACCTTCATCAACCA
AGCTAAATACACTCAAGACATGCTCAAAAGGTTCAATATGAATGAACTAA
ATCCGCCCAAGGCCAACACTCCTATGCCTCTCAAATGCTACTTGATTTTT
GATCCCAATGGTAAAGTCGTGGATTAAAAGGTATACCGCTTCATGATTCG
ATCCGTGCTTTATCTTTGTGCATTTAGGCGGGATATTATGTTGGTTGTGA
GAATTTGTGCACGTTTTCAATCCACACCTAAGGAAAGCCACTTTATGGCG
GTCAAGCGAATCTTTCGATAATTGACTCATACCCCAAACTTTGGCTTATG
GTAACCCAAAGGTGCTTCATTTGATCTCATAGGATACACGGAATCGGATT
GAGTGGGAGACCGTGTGAAGAGGAAGTCAACTTCTGGAGGCTGCCAATTC
CTTGGTCGCTCTTTGATAAGTTGGTCTTCAAAGAAACAAAATTATGTTTC
TCTCTCGTCCACCGAGGCTGAGTATGTAGCCGCCGCCGGCTACTATCCAC
AGATTCTCTAGATGAGGCAAACTTTAATGGATTATGGTGTTATTTGTGAC
AAAGTGCCTCTTTACTGTGACAACGAAAGCACCATCAAGATCTCCAACAA
CCCGATTCAACATGGAAAGACAAAGCATATTAAGATTCGTCATCATTTCG
TCCGGGAGAATATCAAGCGCAGGGAGATTGATCTTATCCATCTCAACACT
AATGGGCAGGATACAGTCGCCACTCGAAGAGCCGCCGAAGCACAAAGACA
TTACCCATGTCATCGTCGAGCAACAGGGGCGAGTGCCATTAGGTCCACGG
GGAAGTTCCTTGTAGTGGAGGGCACCACAACGACT