NAME_ID = DTC_Nico_AY853252-1
CLASSIF = DNA transposon, TIR, CACTA
COMMENT = degenerated CDS
TREPACC = TREP2023
ORGANIS = Hordeum vulgare
SIZEDNA = 9779
SSOURCE = AY853252
RELDATE = 20-AUG-2005
SUBMITT = Marion Roeder
REFEREN = Cossu et al., unpublished 
ANN_TSD = 
ANN_LTR = 
PROTEIN = 
>gnl|TREP|TREP2023 DNA transposon, TIR, CACTA, "DTC_Nico_AY853252-1"; degenerated CDS
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CTGTCCCACCGCCGCCCCGCCGTCGTGCTCCTCCCCAGCATCGTCCTGCC
CTCCGGCCGCCGCCCCACACCGTCCTTCTCCTCCGTCCACCCAACATCGT
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GAATCTCTTCACAAACTTGAAGCTGATTCTAAACAGGAGCTATATCCAGG
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AAAAGAAAGCATAAATCTTAAGCTTGTAGTATGGGTAGATGGTTTTAATC
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CCTTATAACTTTCCACCCTGGATGATTATGAAGCAATCAAATTTCATTCT
ATCATTGTTGATTCCTGGCCGAAATTGACATGGATGTCTATCTTGAGCCA
CTAGTTGATGATATGGTAGATATGTTTGTTGATGGTCTTAGGACCTATGA
TGCTTCAAGCGGAGAATATTTTCAGTTGCGTGCTGCCATAATATGTATAA
TTACAGACAAATCGGGTCTTGGGTCTTTGGTTGGTTGTGCTACCTCTGGG
AAGGAGCTTGCCCTGAATGCCACTCCCATGTATGTTCTCTTAGGCTGAAA
AATGGTAGCAAGACTTCCTACATGGGGCATCATAGGTTCTTACATGCAGA
TCACCCCTTGAGGTATGATACAGGCACATTCGGTGACACAGAACTTGGGA
CAACACCCGTTCCACTTACCGGTAGGAAAATCTTAGAGCTGACAGAAAAT
ATTCAAACCAAGTTTGGGAAGGACCCTAAAACGAAGAAGCCTAGAACTAA
GAAACGCAAGAAAGGGGATCCGCTGATCATTTGGAAAAGAAAGTCTGTTT
GGTTGAAACTGCCTTATTGGAAGGATTAGAAGATGCATCATAACTTTGTT
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AAGCACTCAATATTAGAAAGGATCTTCAACCTATTGATCTTGATGATGAT
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AGAAGAACATTACCAGAAAGAGTGAGTGCGGTATTGATTTGTGTGAGCAT
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GGAAAGCTCAAGGGACATGTACACACTAAAAGTCATGTGGAAGGATCGAT
TGCGGAGGGCTATTTGTTTGACGAGAGCTTGACATTTTGCTCACGCTATT
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ATGGAAGTTGATGATACAGCTCCTTTCTTCCACAACATTGGTCGAGGGCT
GGCCGGAAAGTGCATGGTGATGTTAGATAACAGAACTTGGCTGCAAGCAC
ACAAATATGTCTTGTTCAACTATGACAACATAGAACCATACCTAGAGTAA
GATATCCATACTAGGTATTGCTTTTACGTTATTTTTTACTTCCTTGTCGG
TTGATAAATGTATCCTATATATGCAGCAAACATATGGAGTACCTTTCTTA
TATTGGTGTTCGAAGTCATCGAGAAGTCAATCGTGTGCATTATGAAACCT
TTCACGAGTGGCTTAAAATGCACATAAGTGGGCATGTGACTTTGTAAACC
TACAATACATAATTCCATTATAGAGTAACATTAGCATTTTGTAATCACAG
GTGGCAGAAATGGCCGATGAGGCACCACACGAGATAAAAATATTAGCTAA
AGAGCCAAACATGGTCGCGATGAAGTATAGTAGCTACACTATAAATGGGG
TAGACTTTCATACCCAAGCATACGACGAGGGCCGGCCGTTTCAGAGTAGT
GGAGTAGCTCTTGTTGGACAAACCACGTCTTTTGCAAAAGGAGAAAGTGG
CAATATTAGTGTAAGAAACAAGACATATTATGGCATTAGAAAGGAAATTC
TTGAGGTAAACTATAGACATGAAGGGAAAGTAGTGTTGTTCAAATGTGAC
TGGGTTGATAATCGTGTAGAAGATGAATGGGTAAAAACCGATTAGTTTGG
GATCACTTCTGTGAATTTCAAGCATGTATTTAATACCGGTGAGAAAATAT
CAGATGAGCCCTTCATATTAGCCACACAAGCAACTCAAGTTTACTATGTT
GAAGATCCCATTGATGCTGAGTGGTCTAGTGTTTTTGTGCCATCATTGTA
TGACATAGAAGAATTTGAAGATGAAAATGGTAATGTTTTACGTGTGATGT
TGCCTGATCCATGTAATGCCATACGTGTGAGTGTTGCGTATGGAGGCATT
GGTTCTGCTACGACAGATATAGATGGACTAGTTCTTAAAGCTGGTGATAT
TGAAAAAAAGTAAGTGTTGTGTACGATCCTGTAAGTATTTCCAGTGATGT
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AGAGTATGAGTTACAGAGAAGTAAGACCATTGAAGAAAATGATAAATGGA
TAGCAGTGGTACGGGCAACAAAAGCTTCTATGCAGGAAAATATGGAGGCA
AACCAATCCTCCAAAAAGAAAAGAAAGGTGAATTTCCATCAGATTCATTT
TCTACCTAAAGAAAGCAAATGTAGCTTTCAACACTAACTATATATCTATG
CAGGCATCCTCCAACGCATCCTTCCAAAGGTATTGTAGTATAGTTGCTCA
TATTGTATCCTAATGTCACTTGCTAGAATTGTTGTATGACTATGTTAATT
TTCTTGCACGAAGAGATTACTCGTGAGCTTGATGATGAAGGTAGTCAGAA
CAAAGGTGGACGGAAAATTACTCGAAAGGCTAACATATATGCTAGGCTCA
ATCAACCCAAAATCCATATTCCACTTAATGGGAATGGCCAGCCTGTTGGG
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AATAGGCATTTTATGATCTGGATTCATCCGCTTTGAGCTTTGTTATCAAC
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CACTCTGTCAACATGGCTACTCATCATAAATCTGCTTTCCTTTCTTCTTG
TAGTCTCGCAGTGCTATCGCAAAGAGGAATTGTGCCAATGAAGTGCCTCA
TACATCTGGCAGCAAGATTCATGCCCGTGTTGCCGATGAAATGGTAAAAA
TAGTTACCCCCATTATAAATGGCAGCAAGAGTCTTTGTTGCTAATGCATA
AATAAATGATTGCAGGCTGTCAAACTTGGGCATGAGCCTCGAAGAGATCA
AGTTTATATCGAAACACATACATGCAAGAAAGGGGATAGGAAAGGTAGCT
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GTATGTGGAATTAAGGGGCCAAGGGATCATGTCCGTGTGTTAGGTCTAGG
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GGAATTGATGTTGGTTTCACAAAGAGGGCATGATATGGAAACTCCTAGCT
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TCCTTGCATCAATAATCCTTCTTGCATGCAATAACTCTGTTTTCCATATT
GTTGTCTGAATAGAACTCAAGACTTGAAGTTGAGGAAGATAATGATGGCG
AAGAAGATGATCAAGGGGATGATGAAGAGCCTTTTATTCATAGAAGAGTT
GTTGCAAAGCCCCCTGAAAGAAGCTCATCAACCCATGAAGATGAAAGCCT
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GTTTCTAAAATTATCATTGATTCAGATTGGTATGGATGTGCTTCTATATG
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GATCCAGACACTATTGTGGGCGAAGAGCCCCTTGGACCAGGGACTTATGA
GGTTGTTGTCAATGTTGCGATCAGAAGGGATGCTACGGTGCCTTTTGAAT
GTGACGGTTTACAATGTATCGTTGATGCTGTCACAAAGTCCATTGCATGG
CCATCTAGCAAGGTAATCACCAACAATATATGTTCTGTCCACTTGCCTCG
AATTGTTTGGCGTGTGATATTGACTCATGATTACTTTGCCAGATGAAGCC
CAACAAGCGAGGGGCATCTTCCTCGACCTGCCGCTAAGGTACTGTCCTTG
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GTTAATAGTTAGAAACTGCATCTGCACTTGTGTTAACGGTAACTTACAGT
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GGTTTTAATTTGTAATCATGTGTAGCTTTTTGGAATCATATATAATTACC
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TGTGTAGTTGTGGACTAAACTTACATCATAGGGGGCACTACTTTGCAGCA
GGATATACTTTACATCAAAAAGTAGTTCTATCTGCATCTCTTCCCCGCCA
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GAAACAAAAATTATCTAACTGAATCCAATTTATATTTTATTTCTTAGAAA
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TTTGTGGCGCAACACTCAACAAATTTACTATTTGACACTCTACCACAACA
GTTATGGGATGTGCCTTCATATAACTGTATATTTAATTAACCTGACTGTA
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GGAATAATATTCCACAATTTAGACGCCATTTTAATTTCTAATAGTAAAAA
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AGCTCTCGTTAATTAGCTGGGTATTTTATAGCAAACAAACATAGATGTTT
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CTTCAAGGGCCAACAGGATGTCGGTCGGGAAAAATCCATGACATAGCCGA
TGGACTGTCGGTCGGCAATTCTTCCTACTATCGTCGGTCTGTTGGTCGGC
AAAACTTTGTCGGTCGGCAATGGGCTTTCCCGTCTGGTTTTTCCCCAACA
GACCTCATCGGTCGGCAATACTTTCTCCTAACAGACTGTCTGTTGGTGGA
AGCTGTTATCCCGACCAACTAGTATGTTAAGAATGTAGTGATGTGGTGTA
GTGAAAATACCTTCATCAAGTCCATTGTC