NAME_ID = DTC_Sandro_consensus-1
CLASSIF = DNA transposon, TIR, CACTA
COMMENT = consensus sequence
TREPACC = TREP3429
ORGANIS = Oryza sativa
SIZEDNA = 11931
SSOURCE = OSTIGR5
RELDATE = 21-JUL-2008
SUBMITT = Thomas Wicker
REFEREN = 
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>gnl|TREP|TREP3429 DNA transposon, TIR, CACTA, "DTC_Sandro_consensus-1"; consensus sequence
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GCATTGCACCATATGAATGAAAACAACAAATCCTAACCTTTTTGCCACAA
AGATCCAGAATATTGTCATGGTGCATATTTTGCTGTTCCTCACATCTTCT
TTTGTTCTATAGTGGAATGGACAATAAAAATTTACTATAGATGCCAGTAT
GTGTATTGAGTGTTCAAATAAAATTTATCAATTAGAAACGACAAAATACC
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AGTGTTTTGACTAATTTTTTTAATTCCCCCACTTCCCCTCTAACATGTGT
CTCTTCATTCGATGATGAGTCATTCACTGTAGTGATGTTTATGTTCTTGA
GATGATGTGATGTACGACCATAAACCTGCTTAGGAACAGGAAGTAATCCC
ATTCCGTGCACTTGGCCAGGTTTTTCTTTGCCCAATACTTTATTTAGCGC
ATCACCTTCCCATGCAACTCTTCCTTGGTCATTTTGTGCCAACTCTGGTT
GTTCATCGATGAGGTTCTCCAATGTGACCTGCAAGTGAAAAAATATATGC
CCACTGTACAAGGTAGATAACATACATATTAGATATTTATGGAAGGATTA
TGTGTATATGGCATACCACGTGTTGATTTTTATCTTTATCCTTTTTTTTG
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ATCTTGTCTCTGAAAATGAAAGGTAATGTAAGAAAGTAAAGTGAACATGT
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CGAGCATAACTCTTTGTCCCTGCTGAGTGAGGGTTCTGTAACATTGAACG
ACTTCTTTTGTTCTTTGCACTGAGGGCCTATTACAGAAGCAATGTAGTCT
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ATATGTCAATGAGACAATAGTACAGATTGTGGAGCAGATTTTTTACCTTT
CCTTTTTTTGACTTCCAATATTTGATAAGTGGAATCCATTGGTCTTTTTC
TACATCGTCTGGACAAAGCTTATACAGAGCAGAACGCTTCTTCTTTGGGT
TAAAATATTTATCTTTTAGTGCAGCCTTGTATCGCCTCCAATCTCTTCCA
ATTGATTTCAGTATCCATTGAACGCATGATGGAGGGTACAGGAAATTTGT
CTGAAATACATAGGAATAATGAGAGTAGAAGTATTTGAATTTGCATGATT
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AATATCTGTAAAATACATATAAACATTGAATCGAAAACATTCAGTTGCCA
TGGATATGAACAGATGCATCAATCTGAGAGTAGGAAAAAAGTAATGACTA
GTAATACAAACAGAGCATTATACTTATGCTATTTTAGCGTTTGAGGTACC
TGGACAAATTGTAGTATTGTTAAATCTCCTTCATCTGCTTTGATCTTTCT
CCAGGTCATCTTATCTAATGGACAGTAAGCTCCATTTCTTGCTAATGTGC
CCAAAAACTGTCCTAGCAATCCACCTTCATCCCCGATAGGTTGCCCTAAT
CTGTTGCATTTTACAACTATACGTTTCCCAGGTGGAAGATCCCAAACATA
TCGCAAGGTTGTCCCCTTGCGCTTCTTCACCTCTTCATCTTGTACTACAA
AATTAATTGACATAAGGCTCACTAACTTTAGGTTAACCATATATATGCAA
TCACAAACTATTTGGGATTCAGGTAGTTAAAGTTTTACCAGGCATGTTGA
GGGGCTCATCATCTTGCTGCTCAACATGAATCACCTCGTCTTCATATGGT
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ATTTCCATGGTGACAGCTGCTATGTACTATGTTCAACCTTTTCTTTCCAG
CCATTTTGCCTGCAAAATTGGCTTACTGTATTTCAAGAGCACGAATTAAT
CTATGTGTATGTATGCTTGACTATACGGGAATATTGTACCAACTACAACT
ATCTCTGCACAAGGAGTAAAAGATTAGAAGACTATACAGTTATAAGTGTA
GTATATGCATGACAAAAATATAATGGATGTAGCACTTTCAGCTAGAGAAG
AATCCAGAAAAGAACCAAACAAATAAATATTCCTTTTTCTCAGCACCTTC
CATTCCCACAGTACTGGAAAGCAAATAAATCATCAATTGCTCTTAAATGT
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ATGGCTTAATATGATATAACTGGATGCATATAATTGAGCTTAAATGCGGT
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ATACGAGCATAACAAATTTTCAGTTCCACATGGTAGAGGTGGAGATAAAA
GTGAGAATGAATGCAGTAACCTAAAATTGACTATTTCACACAAGAATCTT
CCCCTGCTTCTGTACTTTGCATAAACTTTGATTATTAGTCGGAGCATACA
TTTTGATTCGGTACTTAGCATTATCAAGATATCTAAACAGGAATATTTTG
CACACAACTAATTACATAGATCTGGCAACATAAATCCAATTAATTCATTT
CACAATAATGTAGTCAATGTCACTGAACATATGTCATTAACCTGTTCAGA
TTGTCTAGCAGATGCTACCACGGTTTATCAAATAACTGCATGTTTGATCA
GAACTTCAATAATCATCAGTGGGAACTAATTTTGTTTCTTGTACAGAAAT
AAACATGGAATTTAGATGGTGGTACCGGTGCTTTTCATCGAACACATGGT
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TGATCTAACTCTCAGAAATAAGCATCAGGAATTTTAGAGAGAAGGTACAC
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GGGAGCAGAAGACTGACTAACTGATTCCAGGTTGAATGGGGATTATATAG
GGAGCTTATTCGTTGAGAGAGATGTGGAGAGAGATTAGCAGGTTTGTTAC
TCTAATGTTGCGGTACTACTTGGAGGGAAAATTGAGTTTGGCGGGAAGTA
TTTGGAGGCAAACTACGCATGAAAAAACTCAAGGAATTTCCTTATTGAAA
AAAAAAGATACATCTCAATTTTTTTACAAAATTGGTTAATTACTACATTA
GTAATTTTGTACCTTACTGATAAAAATTAAGGAAATTCCTTATGTGATTA
ACGTGATCCCCTAATGACTGTGTCCCTCTGCTAGCTCTCCCTTCATTTTT
ATTCAGCAGAATAATATTATTTTAAAAGGGTATCTATATCATATAATATG
AAACTAATGGTTCTTTTTTTTCCTATTCTTTTTACCCGATTGTTTTTTTT
CATATCATATAATACAAAACTAAGGGGAGCCATGCATTGTACGGACAAAT
ATGCTTTTAGTTTATCACATTTCTTAATAACACCGAGCCTCTAATTAGTA
GGTACGGTCCAACGTTTATTATTGGTCAAACTTGATTTATAGGGTCCGAT
GCTAGGAGAATTTGTAGTGTTAACGTGTCGAGTGCGGCTTTCTAAAGATA
GAACTAACAGCGACGCGTCGCTCTCGGGCTCTCTACTGTTGGTGTTGCCG
GCGGCTGGCTTTCTAAAGACAAAGACTAATGGTGATGCGTTGTTCTCGGG
CTCTCAGCTGTTGGTGTTGCCGTCGCAGCCGCCGGGGAGGGCAGCAGCAT
AGATCTCCTTGTGGAGCTTCACGCACAACATCCCTTACAAATAGACGAAT
TTTAATGCTCATGTCCTAAAATATAAGTATTTTTGTACTCCGACAAAGTC
TTCGAGATGCATGCTATTTTCACATTATATTTATAAAAATAAAATATTTT
AAATAAAAAAGTTACATATTAAGATAGTTTGATTAATGATAAATCTAGTA
ACCTCAATTTTACATGATTATATTTTTATTTTTTTCTATTAATAGTCAAA
GTTAAAAATGGTTGACTTTACATTAGGCTAAAAATGTTTATATTTTGGGA
CGGAGGGAGTAGTATTTATCTAAAAAGACACATTTGCAATGGCACAGATA
AAATAGTGTACACGTGTTCTAGCACTTAAAAATGTGTACACGTGTTCTAG
CATTCAGAAGAGTTAGCTAATATATTGCATCTCACCTATCTCCCATTCCT
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TCCTAAAAAAATGGCAATCATTTATTTCTCTCGTTCCTAAAAAAAAGAAT
TGCATCTTATCTGTTTCTCTCATTCCTAAAAAGAAAAGAATTGCATCTAA
TCTATTTATATCGTTCCTGAAAAACATGAAAAAAAAAGAAGTTCCTGGGC
TCATCAATTGAGTCTAGAAACATCTTTTTGCATGTTTCTTTCTCAATTTC
CTGGGTTCACTTCTCCTTATCCAGAAGCAGTTGTGATACCGATTGAGAAA
CACGCTCATCTCCTACGTGTAGGCCTGTGCGCTCCCTTCCAATCTTCATC
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TCCCTTGTGCGTGCCACACATCAGCAACAGCGACCTCACCATCACATTTT
CACTTGGTGTTGGTGGATCTGTGCTTGGTGATCAAGACGGTCAAGACCCT
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GTTTTTCTATGCACACCAAGTGTTTGTCATTTTTCTTGTACGCAGATGGC
ATCTTAAAACTTTACCCTGCATCTTATTGTTTCAATTTTTAATCTAGCTC
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TTGGCTCATAGTGCAGTTTAATTCCTCAATTATCATGTAAAGTCCTTAAT
TCTTTATTCTGATTGCTTTTGTCAATCCCATCTGCAGCAATGTCTGATCC
ACTCATGTACTGCTTTGCTATTTTTCTGATCTAGCCAGTAGATAAGATGG
TCGTTTTCGTTTGGTTCAATTAAACAAGCATCAGGGCTGCATCGACGCTG
TATCTACTGGATCCTAATCCTAAGCTTCCAGGTACAGTTAACCTCACCTA
CACATGTTCGGTAGACAAATTTCTTTTGGCTTGAAGGCATAATTATAGAA
TCAAAAATATTTAGTGGTTGTTGTCAAATTAGGAACACTCATGTATTAAC
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CAGAGTCACAAAGTAGAGGAATGGATGGTAACATGCGCCAACTAGTGCAA
GATGCTTTTGGGAACACAAACAATGACCCTCCAGTGAATGAATATGATGT
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ACTTGCTCCGAGATGCTCATGACCCTTTGTGGGAAGGGTGTGAACTTACA
AGGCTGTCATTTCTAGTTCTCTTGTTTCACATAAAATCAGTTAACAAGTG
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GGAAAGCTTGGACTTAATTATGTCAAAATTCATGTTTGTCCAAATAACTG
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GCCAAGGCTTAAGAGGTTATTTATGCACAAGGAAACAGCTATAGCATTAA
GATGGCATGATGAGGGTCGTACAAAGGATGGTGTGTTGCGTCATCCAGCT
GACTCAGAGGCTTGGAAGTCCATTGACTCTAGGAATCCCCAGTTTGCATC
GGATTCTCGAAACATTAGGTTTGCAATGGCTAGTGATGGATTTAATCCTT
TTGGGACATTGAGTTCAACTTATAGTTGTTGGCCAGTTGTCTTGATTCCA
TATAACCTTCCTCCATGGTTATGCATGAAAGCATCTTCTATTATGCTTGC
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AAGATAGAGAAAATTAATGATTTTGAGAAGTCAAAAACATGGAAATGCCG
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ACATTGTTAGGACTGGAAGGCAAATCAAAGGATAATTTACAAGCACGCTT
GGACCTACAAGAAATGAATATAAGGCCAGATTTGCATCCCATAAGAAAAG
CTAATAATAAGTATTATTTGCCTCCTGCTTTCTATACAATGTCTAAACGG
GAGAAACATCAATTTTGCAAAGTTCTCCATGATATTAAGGTTCCAGATGG
CTATGCAGGAAACATCTCAAAATGTATAAATGTTAGTCAAGGGAAAATTT
CAGGTCTTAAAAGTCATGACTGTCATATTCTAATGCAAGAACTTCTCCCA
GTTGCTTTGCGGGGTGTGCTTCCTTACAATGTCACTTCTGTCTTATTTGA
TCTATGTGGATATTTTAGAGAACTGAGTTCAAAAGTCCTGTACATTGATG
TGCTTGACAAGTTAGAGGAACAAATTAAAATGACATTATGTCGTTTGGAG
ATGATATTTCCACCAGTTTTTTTTACCATTATGGTGCACTTGGTTGTTCA
TTTAGCCACTGAAGCAAAATTAGGAGGTCCTGTGTGTTACCGATGTATGT
ATTTTGTGGAAAGGTACATTTCTCTCACAAATATAATTTCATTTGTTATC
TAGTATAGAAATTTTAACATTTTTAATCTTTCTCTTTATTTATGTAGGTA
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GTATTGCAGAAGCATATTTGGCAGATGAGTGTATGACATTTTGTTCAAGA
TATCTTGAAGGTTTTGAGACAAAGCATAACCAGCCTACACGAAATGATGA
TAATGATGAGTCAGTTGCATGTTCAGATGATGAATGCACACCATATCTTT
TTCCTCATGTTGGAAAACCACTTGGCAAGCCGAGAAGTTATGTTATTAGG
GGCTTGACTAAAATGCAAGCACATAGATATGTGCTCTTCAACTGTCCAGA
TGTCAACCCATACCTTCGGTATTAGCTCAAGATCATACACTTCATCACTA
ATCATTTTCTTCAAAGCATACTTCATGACACTTTTTCCTTTTACAGAACT
CATGTTGATGAGATTAGAAGAACATATCGGCAAGGCCGCATCACCCCAAA
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ATGTAAGTTTCGTGTTATTATCATTTAGATCAACAAATAAAATCATGACT
AAGTAATCCTATGTACACAGATAATGGATCTAGAGAGGAAAAATGGCATA
TGCAGTGTCAAGAATGATCATAGATGGCTGGCTCGTGGTCCGATTGGTCC
AGCAAAAAGATATCGTGCTTTCAATACCCGTGGCTTCCGGTTTAGGCCTA
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AACATACTATGGTAGAGTCATCGATATTATTGAGCTAAATTACTCTGGAC
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AATGATTATTCTTTCATATTGCCGAAATGATTATTCTTCCATTTTTTTTT
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