Sequence ID: DB092D16_F1.ab1

Motif:(GCTA)3
Motif length:4
SSR:GCTAGCTAGCTA
SSR length:12

SSR flanking primers:

OrientationStartLenTmGC%Any3'Primer SeqProduct SizeSeq SizeIncluded SizePair_anyPair_3'
1FORWARD5092054.9250.003.002.00GTCCACTCGTCAAGATTAGC1499479473.001.00
 REVERSE6572255.1240.914.002.00GTAGCTGTCCATCAATTAAGGT

Primer view:

1GGTATTCGCGGTTTTAAGATAACTTTGCACACAAAATGCTGTGTCCATCCCGTATGCAGA
61GGCTGAGGGTTTTTTCGTGCATCGCTCGACTGCACTTTAAGACAATATAATTAATGCATC
121AATTATTGAAAAAAATTTGCCAACCTAGCTAGCTAGCTAATTCATTAATTATACTCCACT
181AATTAGCAGGTCAAGTACAGTAGCCCGATCTCTTCGATCACCCCATTAATCCTCAACAGT
241GAACAGCTTTAAATCGCCTGTTAATTCGTCACGTCTTTGCATTCATCTCTGCTTTCTTTC
301AATCTTTCATTCTTTACATCTTAGCAGGTGAGAACCGCGCGGGAACAACTATCCACTAAC
361TTGCAATTAATTATAACGACGTTAATTAATCTGCGCCACACACTGATAAAGCTAGCTAGT
421AGCTTGCAACACATGAAATGGATACTAAAAATAGCTATTAAAAGTAGCAGACCTATAGAG
481ATCGTATATATGCACTCCCAGCTAGGACGTCCACTCGTCAAGATTAGCTTCACAGAATTG
                              >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>           
541ACTTCGAGACTTGGCTAGCTAGCTAGTAATATCGGTGAAGTATATATTCAGCTAATTTGA
601CAGAGCCTTGCAGGTGAATTGTAGGCATGTCGATCACCTTAATTGATGGACAGCTACAAA
                                    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<   
661TCCAAGCAACTGTTTGGGTCTCAACCCAAGCAAATTGAGTGACAAGACACGCCACACGTC
721GCTAGCTAGCAGCTAGCTTAGGGTAAGCTACAGTTTGTTGCATCACCAGCTGCTAGCTAG
781GATATGTCTTCCAGCTTTCGTTTTCAAACTTTAAATTGTGAACATTTCCCTATTAATCAG
841CCTCTCTCTATGCCGTGTGTCGACCAGCTGATCCTTCCCAGCCATGAGATCTGAGCTCAT
901CGCTCACACCACTTTAATTTCCAACTGTGCATGAGGCCTCTGCTGTA
Outer forward primer:>>>>>>>>>>
Outer reverse primer:<<<<<<<<<<
Oligo primer:^^^^^^^^^^
Forward SBE/Allele primer:Blue
Reverse SBE/allele primer:Brown
Target:Red
Included region:Green
excluded region:Orange

Primer3Batch v1.0