NAME_ID = RLG_Sabine_M801L24-1
CLASSIF = Retrotransposon, LTR, Gypsy
COMMENT = complete element
TREPACC = TREP3226
ORGANIS = Hordeum vulgare
SIZEDNA = 7190
SSOURCE = M801L24
RELDATE = 21-JUL-2008
SUBMITT = Thomas Wicker
REFEREN = Pourkheirandish et al., unpublished
ANN_TSD = 
ANN_LTR = 
PROTEIN = 
>gnl|TREP|TREP3226 Retrotransposon, LTR, Gypsy, "RLG_Sabine_M801L24-1"; complete element
TGATACGTCCCAAACGTATCTATAATTTCTGCTTGTTCCATGATCTGTTG
GGTGACATTGTAATATGTTTTGCTACACTTTATATCATTTTCAACATATT
TGGACTAACCTACTAACTCAGTGCACCCAGTGCCAATTTCTGTCTGGTAA
TGTCTATTTTATAGGGGCTTTTACCCAATTTTCCGAAACCCGAAAAATTC
CAGGAAAAATATATAAAAAATCAGCAAAACAAAAGCTTCTGGATCACGGA
AGATGGGCCAGAGGGGGGCGAGGGGCTGCCTAGGTGACCTGCTAGCGCGG
CCAGGCCCTAGGATGTGCCAGGAGGCTGCCTGGGTGGGCCCCACATCCTC
CGGTGCCCTCCTTTCGCCTATATTTAGAGTCCCGAGAGGAAACCCTTCCA
CAACTTCCAGAATCGCGAATTTCTCCATCGTTCCGTCACCGCAGCGCTTC
CGAGATCGGGAGCGTCTGGAGACCTCTTCCCGGCACCCTGGCGGAGGGAG
GATTGACCTCCGGGAGCTTCTTCACCATCATGGATGCTTCCCGAACATGC
CGTGATTAGTCCTCCTTGGACCATGAGTCCATGACCAGTAGCTATGTGAT
GTCTTCTCTCCAATCTTGTGCTTCAATGGTTAGTCCTTATGAGTTGCCCT
ACATGATCAAGGCATCTATGTAATTATCTTGCTATTGCTATGCTCGGTTT
GTTGGGATCCGATGGGTTATGAGATTATGTTCACATTGTTATGAGTTATA
TTATTTTATTATCCTTTTAAATTACGTTCCTTAGTGATTCATGCATGTTC
TTCGTTGCTAATTATTGCTTCGGTCGAGTAGTAGATTGTAATTCTAAGAG
GGAGCGTTATGCATGATTGTGGGTTCATGCCCCTCGATGTCTAGCTTGAG
TGACAGAAACATGAGACTAGGGGATGTGCTATTTCCACCAGGGAGAAAAC
AACGGTGCTTGTGACCACGGTTGCAAGGATTATTTACCTTACGCATAGTT
CGTTAATGCAGTTGTCCGTTGGTTTGAGTTTGCACTTTGGGTGGGGCTCG
CAACTTAATACCGGAGAGATGTTCTAGATAGATATCTCAAGGTGTATGAT
TAGTAAGTAGATGTTGATGAATAAACAATCTACTTGTCTTGGCATACTGC
CCATTACTATTGAACCTCTAACTATCAAGTAGCATAATTAGCATTGCGGT
GCGTTCATAATTCTGTCAATTGCCCAACTGTGATTTGTTTACCCAAGCAT
AGTTGGTTATCGTCTTTCGGGAGAGAGACATCACTAGTGAACATCATGTG
ACTCCGGTCCATATCACCATAATTGTTTACACCTCCAGCATTTACCGCTT
TCATTTACTTTCCCGTTGCAATCACTATTACTTTCCCGCTTGTGTTTTGA
TCCTTTACAAACTACAAGGCCGGAGAGATTGACAACCTCTCTGTACTCGT
TGGGAGAAAAGTTATTTGTTGTGTGTGCAGGTCCACATCTTCTGCTAGCA
CCAGGGTGGGAGACACCTACTTGTTGAGCCTAGGAGTCCTCTTGGTTCGA
TAAACCTCACAGTCTCCGTGTGAGGGAAAACTTGCTGCTGGCTACATCTC
AACCTTCATCTTGGGGTAACCAACGAGGTGCGAGAAGTATATACATCATC
TCGTCATTAAGCAAAGTTTTCTGGCGCCATTGCCTGGGACTCCAGTCTTC
AAGATAGGGGAGTTGCACGCTATCCTTTACCTTTGCTTTTTAGTCTTGTT
AGTTTGCTTTTTAGTTTTTGCTTTAGAGTCTTATACCAAAAACCACAAAA
AAAATAGTTACTTTGCCTTTAGTTCTCAAGCATGTTAAGGTTTGATGTTT
GGAAGGAATCTGAGGTCCTAGATTGCCATCAAAGGAATGGAGAAAATATG
AAGGAAGCTTGCGATAGATTTTCTGAAGCACACAAAAGAATTATGCCTTG
GATACCTATCAAAATTTTGCTTAGAATTTTTTATCATAGTCTCTTTATAT
GGTGCAAACACTGTCTTGATATTATAGCTAAAGGAGATTTCTTAGAGTGT
GATGAGGCAAGAGCTCTTGACATTATACATGGTCTATCTAATAATCTTGT
TTATAATCATGGTTATGACACTATTATAGATAGATTTGCTACCATTGAAA
GGAAAATAGATGCTCTAGACTTAAGAGAAAGAGAGGAACCCATGGTTAAT
AAGGAACATATTTTGAAAATAGATGATGACCGGGAACCTTTTGTTAGAAT
TAGCATCTCTAACCAAGACTTCCTTGCTTATTGTGATATTGGATACATGG
TTTCTACAATGCCAAAAGTTGTTTATGATTCTCTCTAGTTAGACATGGAA
TTTTTTTATCTTATCATGAACATGCTAATGGTGATATTTCTGAAATGCAG
CGAAAGGTAAAAGATGTCCAGGTTACATTCTCTAAAAGGAATGCAGTGGT
TGATTTCTTCATCATGGAGCCCAACAAAGGGAATATAGTGCTTGGAAGGG
ACTTCCTCCAAGGCATGAGAGGCTTCATTGATATAGGTAAAGGACACATA
CGCTTACATGGGAAAGCGAAAGGTACGTACCCATTCCCTAGGAAAAATAA
GGATGAACTTGTTGAGGATCCATTTAAAGGTCTTTATAATTCCGATGACC
TTGGAGAATCTTGATCCTTCTTCTTGCATTATGCCTAGCTCAAAGGCATA
AAAGAAAGCACTTGTCGGGAGGCAACTCAATTTGTTTTTACTTTTTTTTA
GTGGTATTGATGCTTGTTACTACTGTAGCAACATCATTGTATCTTTATTT
TTAAGCTTTGTGCCAAGTTATAGCCTCCGATTGCAAGAAAGTTCAAAAAT
TGTGACATGCTGTCCAAAAACAGATTCTGTGTGCCTGACGAAAAAAATAG
CCAAAAGTCACCAGATCATCTTTTTTATCTGAATTGTTTTTACAGCATGC
TATATATAATTGCCTTTATGGCATCTGTTCTGAGTTTTTTTATTTGAGTT
GCAGAAGTGCCCCGAATAAATTATTTACTACCTCTTGTTTAGTATTTCAT
AGATTCTGCCATGTTTTGCATTTCCATTGTTTGGCGAATCCTAAGCTTGC
TTTTTATTTGCAAAATCCTTTTGACAATCATGATAAGCAGTAAATTTTCA
TGAAAATCTTTATTTACATCAGGTAATGAATTATTTTTTTAAGGGTACTA
ACCACTCTAATCAGCTTATGATGAGTTTTGTATGAAAGGAGTTTTCAAGT
ATGCGATGGGAGATTATGAAAGAAGATACAGGTGGGTCAAGCGCTCAAGC
TTGGGGATGCCCCCATGCACCCCAAGAAATATTCAAGGATACTCAAGCGT
CTAAGCTTGGGGATGCCCCCGTGCATCCCCTTCTCTATCAACAATCATCG
GTTCGTCTATCTCCATGCTATATTTTTATGACTTCATATGTTATGTGCTA
TGCTTGGAGCGTCCCGCTATTTGCTTTTTTGTTTGTTTTAGTTTTGCTTG
TTGTTCATAACAAATCGGAACCAAGCCTACCTTGTTTGGGAGAAAGACAT
GCTCCATTCCACACTAGAACACAATATAGGTTTTCATGCTTATCTTTTTT
GTGTGTGCTTCATCTTTCCATAGCTACTGTCCTGCTTAGCTCTTAGGTTT
CATGCTTATATTTCTAAGAGCTTTTATTTAGGTTGATTTTGGAACTCTTT
TGAGTTGTCATGCTTATCTTGTTTAGAGAATTGGCTCGTTGCACTGAGTA
GTGTGTCTTGCATGAGTAGGTAATTGAGGTTGCTATTTAAGTATAATAGT
AACTTGCAATAGTTTTGAGGTATTGATTTGAGTAATGTTTGGACTATTGG
TGCCAAGAGCTTGAGCCTATTAGTGATAGGTGTCGTATTTTGGGAAATCC
GTGAGTTTTTCAAAAACTTAAAATTAGTTGAGAACTCTAGCTACTAAATT
GATCGCTAACCTCTGGAGTGGTTGGAATATATAGAGTACCCTCACGTTAC
CATGAGTCGAGGATGTGCAAGGATAACCAAACCCCCAAACACTCCTCCTC
GGGGTACTTGTCTTTTGTGAATTTCCTTACTAGATAGAGAGTTACCGATA
ATAAGTCTATGTGTTCTTCAGACTAATGTGAGTATTCGATTGTTGGTACT
TCCACCATCCATATTTTGCTAGCCTCTTCGGTACCGTGTGTTGCCCTTTC
TCACATTGAGAGTTGGTGAAAACTCCACCGGTGCATCCAAACCCATGACA
TGATATGCTCTGTCATACATAAGCGTCATTATATCTTTCCTCAAAACAGC
CACCATACCTACCTATTAAGGCCTTCCCATAGCCTTTCCGAGATAAATTG
TCATGCAACATCCACCATCTCATGACTTGATCTTCATGTCATACATGCTT
TTTCTTGATCGTAGAGCCGCATAATAGTTGGGCCTTACCCCAATTATTGC
TACATGATGCGCTAGTATCATTGCATATCCTGCTACACTGGCAGAGGCAT
ACATTTGCATACATCAAGATAGTTTTGATTTATCTTTATGTTGAGTACTT
CTTATAAAGTGTGAAGATCTTCTTTTTATTCTCGAAAATATAGAGTATTG
CCCTTAAGTGAGGAAAAGATCCCAAAGAGGACAAACAAAAGATCCCAAAG
AGGACAAATGGGAGATAAAAAGAAAGAGCCAAAGAGGCCACAAAAAAATA
AAAAAAGAGAGAAAAAAAGAGAGAAGGGGGCAACACTACTATTCCTTTTG
AAGATCCACACTCGTACTCTATTTCTATATTGGTACTACATAGAGATTAT
CATTCATGCATAACTATGTGCGGACCCTTATACAATATAACTTGGTTTGC
ATATTCCAATGATGAGCCTCCTCAAATGAGCTCTAGTTCTTCATGAGCAA
ACAAGTTGGATGCACCCCACTAGTTCCATTGGAGAGCTTACCTTAGCTCA
TATGTGCATCCGTTACATGGCAATCCCTACTTCTCACATCATATATATCA
TTTGGCTTTCTCTCGCCCATGGTTGTCCTCATTCATGTGAGCCTTTCACA
CCTTTTTATCCTCCTTCCCCATCATTACTCTATTTTTCATCCTAAGTGTC
AACATATCTTGCTTACGCTCATCCATTGCATGAGTGCTCAAAGTCGAAAG
GGAAAGGATCATTTTGACTTGTGCCTCACTAGTGGTCTGGGGATGAGTCA
AAACTAGATTCCAAAGGAGACCAAGTGTGAAAGTTTAGTAGATTGAGTTC
TCAATTAAAAATAATTTATGATCTCAACCCATCTCCCACTTCTCGCATGC
AAACACCATTTGGAGACATTCGAGTTACGGACAGCGAGAGCTTTTACACC
TTTATGTACTTACCTTGCTAAAATTCAATACTAGATATAAACTCTTGCTT
GTTATTGTCTTGACTTGAATTGCATTTCTCACTTGCTTTACTTTGAAATT
CTTATATGTGTGTTAGCATGTCACCACAGAAATTATTGTGTTATCATTTA
TCTACTATAGGACGAGCGGAAATTAAGCTTGGGGATGTTGACGTCCCAAA
CGTATCTATAATTTTTGCTTGTTCCATGATCTTTTGGGTGACATTGTTAT
ATGTTTTGCTACACTTTTATATCATTTTAAACATATTTGGACTAACCTAC
TAACTCAGTGTACCCAGAGCCAGTTCCTGTCTACTGATGTCTATTTTGTA
GGGGCTTTTACCCAATTTTCCAAAGCCCTAAAAATTCGAGCAAAATATAT
AAAAACTCAGCGAGACAGAAGCTTCCGGATCACCGAAGATGGGCCACAGG
GGGGCCAAGGGCTGCCCAGGTGACCTGCTGGCGCGGCCAGGCCCTAGGCC
GTGCCAGGAGGCCGCCTGCATGGGCCCCACCTCCTCCGGTGCCCTCCTTT
AGCCTATATTTATAGTCCTGAGAAGAAACCCTTCCACAACTTCAAAAATC
GCGAATTTCTCCATCGTTCCGCTGCCGCAGCGCTTCCGAGATGAGGATCG
TTAGGAGACCTCTTCCCGGCACCCTGCCGGAGGGAGGATTGACCTCCGGG
AGCTAGTCCACCGCCATGGACGCTTCCCGGACGTGCCGTGAGTAGTCCTC
CTTGGACCATGAGTCCATGACTAGTAGCTATGTGACGTCTTATCTCCAAT
CTTGTGCTTCAATGGTTAGTCCTTGTGAGTTGCCCTAGATGATCAAGGCA
TCTAAGTAATTCTCTTGCTATTGCTATGCTCGGTTTGTTGGGATCCGATG
GATTATGAGATTATGTTCAGATTGTTATGAGTTATATATTTTATTATCCT
TTTATATTTTGTTCCTTAGTGATTCATGCATATTCATCGTTGCTATTTAT
TGCTTTGGCTGAGTAGTAGATTATAACTCCAAGGGGAGCGTTATGCATGA
TTGTGGATTCATGCCCCTCGATGTCTAGCTTGAGTGATATAAACATGAGA
CTAGGGGATGTGTTGTTGCCACCAGTGAGAAAACAACGGTGCTTGTGACC
ACGGTTGCAAGGATTGTTTACCTTACGCATAGTTCGTTAATGCAGTTGTC
CCTTGCTTTGAGATTACACTTTGGGTGGGGCTCGCAACTTAATACCATAG
ACATGTTCTGGATAGATATCTCAAGGTGGATGATTAGTAAGTAGATACTG
ATGAATAAACGGTCTACTTGTCTTGGCGTACTGCCCATTACTATTGAACC
TCTAACTATCAAGTAGCATATTTAGCATTGCGGTGCGTTCATAATTCTAT
CAATTGCCCAACTGTGATTTGTTTACCCAAGCATAGTTGTTTATCATATT
TTGGAAGAGAGACATCACTAGTGAACATCATGTGACTCCGGTCCATATCA
CCATCATTGTTTACACCTCCATCATTTACTGCTTTCATTTACTTTCCCGT
TGCAATCACTATTACCTTCCCACTTGTGTTTTGATCCTTTGCAAACTACA
AGGCTGGAGAGATTGACAAACTCTATGTACTTGTTGGGAGCAAAGTTATT
TGTAGTGTGTGCAGATCTACGTCTTCTGCTAGCGCCAGGGTGGGAGAGAC
CTACTTGTTGAGCCTAGGAGGCCTCTTGGTTCGATAAACCTCACAGTCTC
CGTGTGAGGGAAAACTTGCTAACTACATCTCAACCTTCCACTTGAGGTAA
CCAACGAGGTGCGAGAAGTATATACATCATCTCATTATCA