Query (optional)   in Class  

GrainGenes Map Data Report: Saccharum, Cornell

[ Printable Version ]  [ Submit comment/correction ]

Map Data
Saccharum, Cornell
Map
[ Hide all but 1 of 44 ]
Saccharum-1
Saccharum-10
Saccharum-11
Saccharum-12
Saccharum-13
Saccharum-14
Saccharum-15
Saccharum-16
Saccharum-17
Saccharum-18
Saccharum-19
Saccharum-2
Saccharum-20
Saccharum-21
Saccharum-22
Saccharum-23
Saccharum-24
Saccharum-25
Saccharum-26
Saccharum-27
Saccharum-28
Saccharum-29
Saccharum-3
Saccharum-30
Saccharum-31
Saccharum-32
Saccharum-33
Saccharum-34
Saccharum-35
Saccharum-36
Saccharum-37
Saccharum-38
Saccharum-39
Saccharum-4
Saccharum-40
Saccharum-41
Saccharum-42
Saccharum-43
Saccharum-44
Saccharum-5
Saccharum-6
Saccharum-7
Saccharum-8
Saccharum-9
Species
Saccharum spontaneum
Female Parent
Saccharum spontaneum ADP068
Male Parent
Saccharum spontaneum SES208
Type
Genetic
Map Units
cM
Reference
Referenceda Silva JAG et al. (1993) RFLP linkage map and genome analysis of Saccharum spontaneum Genome 36:782-791.
Contact
Sorrells, Mark E.
Remarks
90 progeny, 216 markers. Mapping criteria: LOD=3.0, recombination fraction=0.25. Linkage Distance is in centiMorgans using Kosambi mapping function. ADP068 is a doubled haploid derived from SES208.
Locus
[ Hide all but 1 of 216 ]
BCD0178a31131313333311113311313313311113011331133333111113 1111111313311113331131313133313113331331
BCD0178b11313313101331313311311111133311313013331111313311 1313313111311311113311131111113331133333
BCD0178c13133133303133311331133311333331313311311113031133 1111313133131131333113133313331111313113
BCD0263a13101111103333311311111111110131110333111111031013 0113311100331131333113333333333133311131
BCD1051a33311333113113311331313311113311311111331111113333 1331111103311333313313311333333131331133
BCD1095a33133111301331333313311311311333110131113333111113 1131113113113111311331111033300013313313
BCD1381a11313331111131311300111113133311113113331313313311 1113131101111131300333331331131330113331
BCD1381b11311133133301033131313131311311310313113111011133 1131333300110333113113333131133330133113
BCD1381c33113313310113031313131113311131330333131333033331 3000000000331311111313333313111110133313
BCD1424a33303033330303133111033311133333111113131111313313 3311331313013111113113311313331131133313
bcd1643a33301333113113011331313301013311311311331111113333 1331001113311333303313313330000131301133
bcd1643b33113311131313033111331301103333131133333113113331 1311113131131131301333111113331313313111
BCD1707a11113311331131313313311101111131331311313131311113 1111333131313313131111311111113333331331
BCD1707b31333133313113331331111301333313131111131311133331 1131111331311131313313311111311113313313
BCD1716b31311311113333131311110301313113133131110113131331 1103333333133133133331311333333311131333
BNL509b33111113131331131311033111133333131111113333111111 3331131111311131311311331111331133331133
BNL911b11113333331113333133013111313133133113131313111133 1313333311331311333313311133133313113331
CDO0066a31300103110000000000003311113333313113331133331313 13331131311311111331331333131311113113131
CDO0087a33113311131313033111310301113333111133333113103331 1301113131131131311333111111331313313111
CDO0087b11133111313111033113110101111313113111111313331113 3103131333311113113331131311133331113311
CDO0089a33111313311131333333013331113131133111333131133333 1133331333131331131113111133113133131311
CDO0099a11311311130013313313131333311113113111131331113313 1331113131113313313310001110110110333331
CDO0202a31133331331333013131331133313131113111311113331111 3333331133311113313111313111330131311131
CDO0202b33111333311131333333313331113131133111313131131313 1133331333111331331313131131111131031311
CDO0385b33303331311331111331001111331313113131331131113333 3331333330031333113111331311133333111331
CDO0665a11101311133333011110010303133113113111110313301133 1301311333311000003131111333013113113311
CDO0665b00300330303333033131130303111331311313110313301111 3301133131131333131333031113133313333111
CDO1011a03133333103130131333113131331131331331113331333111 3333333133131133331113111333313331111110
CDO1011b03331333301330313331333313113331113113313131113313 3313133113331311113311311311331111313133
CDO1056a11130113113331111311013331313333113103333133131133 1113131133333333311311333111111113113313
CDO1056b31110111111301313113033111133111333331333311311131 3331333111111111331113111331113113311133
CDO1345a11301111313311313113000000000013311113133331311113 1131111313311333113131111331133113333131
CDO1345c33303111333311131311001313011311333131113111333333 1131113333131111331331111313311133331311
CDO1380b31311311110033131301013331313113133131113113131331 1113330003033130033331311333333311131333
CDO1380c11333133333133331303031133311331113111331131331113 1113130000031130011113133331131133131113
CDSB006b33333111331313133111330301133333111113131111313313 3311331313113111113113311311331131133313
CDSB007a31333133311113331333131131313111133111331313133331 1131111331331131113313313331311113313313
CDSB007b31311331113113131131313131113133331313313333331133 3331311131133111311133331330133313111333
CDSB007c33131313331313311313131313133113013111131333111331 3313113313331333313313030133311111311130
CDSB010b31133333331331013131310103313131111111310113301111 3303331133311113313311313131331131311131
CDSB012a11111111133331333113133133133131311311311311131113 1111333133311313131313111133111111131113
CDSB015a33303113331333333111333311133333131113131111013313 3311331313113111113113331313331131133313
CDSB015b11113331113331111133113133111331333331313331131133 1131313131313131333113111133133313311311
CDSB022b11133113103330311313113311313333113113333133131113 3313131133133133311311033133111110133313
CDSB022c11331131333110133133131313111333330313331313313311 1311133131313313111331331113111333113111
CDSB023a33131111131113311310130103131111313113130331101131 3303111113331313313333131133111111311130
CDSB023b31333111133113311111130101113131111133110301301131 3303011331133313133310133311333111130110
CDSB023c33111131111111133133310103131333111113133311331313 1101133131113311333131311311113131313311
CDSB028b33333333333333133113303311133333131113131111313313 3311331303113111113113331313331131133313
CDSB030a11133133331311013133111303313333311313113311313331 1311333131311131113313331111111111313131
CDSB031a13113111113101311313311131133331111113333113333331 3311331311331333311313133111113131131331
CDSB031b13113111033131311313311131133331111113333113333331 3311331311331333311313133111113131131331
CDSB031c13111133333310113331131333101113131133131133111113 0333111331111131333113331331331311313133
CDSB032a10000011100003131331011333333310111130113313333333 1111333131131113313111101133113311313331
CDSB032b30111033310001333333303331113131103111313131130313 1133331333111331331313131133010133131311
CDSB058b31111111133101311301133133313131133333113331331133 3111311131131113113113133313333111331113
CDSB058c33333131131333131131111313331313111133133313313333 1111131111131313311311111111133111313131
CDSB058d33333131131333131131111313331313111133133313313333 1111131111131313311311111111133111313131
CDSB058e33333131130333331131111313331313111133133313313333 1111331111131313311311111111133111313131
CDSB058f31333111133133311311133133111131111133113331331113 1111311331133313113313133311333111333113
CDSB069c33131133113103311331033331311000303300310331131133 1113311133133131133313133110330001113113
CDSB069d11313313311311313311311311131131331113331111313313 3311313111111311113111131313311131113133
CDSC005a11113333331113331133110101313131133113130311101130 0000000011331331333313311113030313111331
CDSC005b33333111313331331311110303311311113131110111303333 3101131333131131331331111313311133331311
CDSC013b31113333330333111103310001101113113131331311131100 0031310000000001311131111333313111131113
CDSC024a33333111313331031310110303311311133131110111303333 1101113333131111331331111311311133331311
CDSC024b31131333111113031131130303131131311331110133113311 3303111111111331111311311333113331113113
CDSC024c01331111310033013311010303303300133133310101103131 3101131313311331113333131111313331311313
CDSC030a13101033110100333300013131331101330001113131113311 1311033133131133331113313130313331131313
CDSC041a33111110311333133301011311331113111111311331113331 3331131313331113133131131330331103113110
CDSC041b31113330133131131101013331333113113133333313331111 1131113131131333311131330330313101331110
CDSC041c31333331131313313301033113103313133031133111311111 1133311131101331311333311110131101311111
CDSC049a11301111133333133111003111311311310331113111110003 1131333313311313133113333111033311113113
CDSC049b33303313331331111313001333113113111111331133130330 1111313313331331331311131131311333311133
CDSC052b33331133131333313333033313113331113113313131113333 3313133113331311113311311331331111313133
CDSC052c31113111133313113111013333133113111101311113333333 1311111331311131133131311111113113313331
CDSC052d13133333113131131333113131331131331331113331131111 1111333133131133331113111333313331111113
CDSC056a11133333110131131333013131311101331011113331111111 1111333103131133331113111330313300111113
CDSC056b31111111130313113111013333133103111011311113313333 1311111301311131133131331110113103313331
CDSC057a33111131111111133333311111333333111111331311311113 3113133331113331333333311313113131313311
CDSC057b33313113331313131111333311133333131113131111313333 3311331313111111113113331300330131133313
CDSR008b31333131111111111131313111113333133133131331111311 1333113313311331133131111313111333113311
CDSR008c11331133331133331333131133311331113111331131331113 1113133113131133311113133331131133131113
CDSR008d31311311113333131311113331333113133133113113131331 1113313333133133133331311333333311131333
CDSR012a11111333333333111301031303111103131033131133111113 3330113300113131333113331331331311313133
CDSR012b11111111113111333313013101133101133013333133113333 1110331310330333111113111113113133131311
CDSR012d33111131111111133333031101133303111013131311311113 0113133331003331333333311311113111313311
CDSR014a11131311133331331111310111313113311331333313311313 3311113111311131131133331311111111133311
CDSR014b33331133131333313333333313113331113113313131113333 3313133113331311113311311331331111313133
CDSR014c11133133131311313133131313313333311313103311313331 1311333131311131113313331110111111313131
CDSR015a11313333311113033131113331333133133113131313011133 1313333311330000033313011133133311111331
CDSR025a33113313033111131113313331333111113133333313331111 3333113131331333113131331331313131333113
CDSR029a33131133131133331133311333331131113111311333133311 3331111313111131113131113131133111313133
CDSR029b31111131111311113133313111133111113131333311313333 1331113111333111331131111331113113311131
CDSR033a11333311030133331333033333311111313331313331311113 3111113331331113133331033313103313333331
CDSR033b33333113331313133111333331133333101113131111313313 3311331313113111113113331311331131133313
CDSR033c11113311110331111103113113111331333331313333131133 1131313131313131333113111133133313311311
CDSR035a13111330033333011130130103133313111133110133103333 1303131331331333331313313311313333131131
CDSR035b31113033333303011133310301133113113131330311101111 1101313131131131311131131333313111131113
CDSR035c11313133111333013331110101131113131131313131303311 1301111331331113331131311333311111131113
CDSR041a31111131113113311131013331311103331013313333001133 3331313131111113111131333331113003313311
CDSR041c33333313331311111313011333113103111011311133001331 1111313313331331311311131131311003311133
CDSR046a31113333333330111103303331133113113101331311331111 1111313131331131301131101333313111131313
CDSR046b13111311333313311111113113133313111103111133113333 1313131331331333331313313311313333131331
CDSR048a13133313333131331303011133311301113011331131131113 3313133133131133311113133330131103133113
CDSR049a33131133113103311331133331310111333303311331131133 1113311113131131133313133113131111113110
CDSR063a33133111313331333313311331311333113131113333333313 3111333131311113111331110133311300333313
CDSR063b31113311313133331313311313313131331033333111311131 3133113333313133333333100311331110311131
CDSR063c11331333333331133131111133131333311311331311333313 3331331113133101333133333000133133331131
CDSR063d11111331133313311131131113133313111133111133113333 1313131331331333331313313311313333131131
CDSR065a13111311311303311313013133013131133103113133331113 1111313111131311113313111333113111113133
CDSR065b13313311133101311313011131033331011110000110333331 1111311311331333331313133113113111131331
CDSR065c11111133133303113311031303331113131131101133111111 1333131331111131333113311331331331313133
CDSR065d11133113333301101313033311331333133133313333313331 3331111311311311131331331133311313111030
CDSR067a33331133111303013333333313113331113113113131113333 3313133131333311303311331133331111313133
CDSR068a33113313000111331113313301133111113133331313331111 0000000133331333113131333333313131333113
CDSR070b11331331333331133133111113131333311311331311331113 1331111113131311133133311111131113113131
CDSR074a31130001113103011131113311311133331313313333331133 3331313131131113111131333330113133313311
CDSR074b31130333311103031133131111313131333133131311113131 3313131333333311111313333333111111133313
CDSR074c01310011133303033111313131311311311331113111111113 1131333313311313113113333111133311113113
CDSR085a31303331311113331131001311113331311330333113111111 3333111313313333113133331311333113131131
CDSR085b11301131113311333331001331113133313331111133331113 1113111311331133131131331310113313313313
CDSR091b11333311313103111133013303333313131131111113131111 1133333313333313311111131113331133113113
CDSR091c33131113130113311313031113131111333303131333111331 3313111113331313313303331133011111311130
CDSR096a31103311130303113111013333113113110131311111333333 1311111301311131133131311113113113313331
CDSR096b13103333110101131331013131331131000331113333131111 1111333133131133331113111333313331111113
CDSR096c33301133131303313333013313113331110113313131113333 3313133113331311113311311331331111313133
CDSR120a11113111113131313313011131133331313113331113333331 3311331311331333311313131111113131131311
CDSR120b11111333333313111331031313111113131133131113111113 1333113331111131333113311331331311313133
CDSR125a33313313130101331113011101111311131133333313333311 3333111111131333103131333331333131333111
CDSR125b11311033111303113331011101131113131131313131313311 1311111331331113331131311333311111131113
CDSR128a33133311333331331313310101333113311331311113313333 1113133311331311333311311133331111313133
CDSR128b11111311133313113111313303133113113131111313331133 1311311333311133113131311313113113313331
CDSR132a33111131111111133133311133131333131313133311311333 3131333101113311333131311333113131313311
CDSR132b31331333003113311331131111133311113113111111331311 1333311103111333131133113311331113311311
CDSR132c11133113331331131313333311131333111133311331311131 3331111301311111331331333131311113113131
CDSR132d31331333113133311131011131133311113113111111331311 1333311113311333133133113311331113311313
CDSR132e31313311133333131311033311331133311311333131313333 1111331313111111113113331333331131333313
CDSR133a11311311113113333303011333113313313331111131331113 1113113311331333133111331313113313313333
CDSR133b33133111311331333313011331311333113131113333133313 3111331131111113111331113133311313333313
CDSR133c11331331333331133111011133131333311111331311131013 0331131113131111333133311111131113111131
CDSR145a03301033110133311331013311113311311311331111330311 3001111130133331303303313333333131331133
CDSR146a11130013110111331113013131331111331013331331331113 1311013133111133011333311111333131311111
CDSR146b31333131333301311331013111131331113111131133111103 1331131111311111133313311131131113313133
CDSR153a13133333003131131333113131331131031331113331131111 1111333133131000131113111333313131111113
CDSR153c33111333001331333333313300013131133101333031131313 1133331333111000331313131131111133131311
CDSR160a13111331111013331131131313113133111111131333113333 1111133331331113333331111311333313131131
CDSR160b31333131333311311331313111131331100111131133011113 1331131111311111131313311131131113313133
CDSR160c11331111311113113311111313313311100133313111113331 1131131313311331113333101111313331313313
RZ004a11111013133331333103133133133101310013311311131113 3111333133311313133313131330330000130013
RZ004b11133311333131331303011133311301113033331131131113 3313130133131133311311133330000000003313
RZ017a33331311133133031113133301311133111113111111311131 1111333311313131331311111113131313131331
RZ017c33331333133113311331313301133311313311131111113333 1331111113311333333333111333333131311133
RZ023a33110330331301013303331313331313113111131311131113 1131311133133331111111131311331333331111
RZ329a33333111331303133111333301133333131113111111313313 3311331313113111113113331310331131133313
RZ421a11131010000001131303033311131333131133311333311131 3331111311311111331331333131311113113131
RZ421b31331000000003311301031131103301113113111111331311 1333311113111333133133133311331113311313
RZ612a11303331300101333133001313311111013331313331311113 1111113331331113113331133111111313333131
SG004a13113333331110333133111131310130113113131313111113 1303013311331311333313011100031313113331
SG012a33111333311111333333313331113131133111333131133313 1133331333111331331313131131111133131311
SG012b31333311113111311111133111113131111111133331311133 1113111331133313133313113311333113133113
SG012c33333311133333131311111333331313111113111313333333 1111133131131313313111111111113311313131
SG012d31133333331333113131331113313131111111311113331111 3333331133311113313111313131331131311131
SG012e33113333333333333313333331111331311113111111331111 1313131313113111131131111111111331111333
SG021a13333331333111111331313133131333111113133133331133 1131111313133111131333111333311113113133
SG026a13111311133313313111313313131113113111131313331133 1311311333111133113131111333133113113331
SG029a11133113331331131313133311133333133133313333313331 3331111311311311131331331131311313111131
SG029b31111111111111133113311133133333311113131311311313 1131333131113111333111311333113131313311
SG030a33311333133130311331313311130311313111131111113333 1331111113311333313333311333333131331133
SG030b11133113313110333113111111110313331111111113311113 1133131333311133113331133313133333113311
SG030c33133311333310133111311331110333131131333313111331 1311113133131131311313133113331313313111
SG054a33130133113113311331133311333311313311311113133333 1111300000133131333110133330331111313113
SG099b33333311333313131313113133111313111113111111333333 1131113313113111131131111331131113111311
SG099d13111111333313313111313313131113313111133311331113 1331311333313333113331111333313311333131
SG140a31111131333313131333311131331131111113111113313133 1133331133113311111313313131111113113333
SG155a31331111311311111111133313131131111113131331333313 1131333131313113333110000000011131131131
SG155d33311333133113311331313311133311113111131111113333 1331111113311333313333311333333131331133
SG161a33133113313113333113111111113313333331111313311113 3333131333311111113331131311133331113311
SG168b33133111131333311313113101133111113113333133113333 1113331313331333111113131113113133131311
SG192a33111131111111133333311131333333111111331311311113 1113133331133331333333311311113131311111
SG212a33331111311311133111333301133333133303131111313313 3311331313113111113111111311131131133313
SG224a33331113311333331313313311311333113131113313333313 3331131131113131133331111131311313333311
SG293a31333311133111311111133111113131111131333331000003 1113111331133333133313113311333113133113
SG298a11311111133313133111311111313311333331113111131113 1133333313311313113113333111133311113113
SG298b31333133311113331333131111313131333313131313133331 3333131333331311111313333333111111133313
SG302a33333331333333131131111333331313111113131313313333 1111131111131313311311111111133111311131
SG302b33111313311111333333313331113131133331331131133333 1133331333131331131133311131113133131311
SG305a13333133313133311331133311330331113111331113331133 1111313133331131333113133311331111313113
SG322a01133333331330113131311113310101111111311113331111 3333331133311113313111313131331131311131
SG322b03333311133330131311111333330301111133113313333333 1111333131131313313111111111113311313131
SG370b33331133131333313333333313113331113113313131113333 3313133113331311113311311331331111313133
SG370c33331133131333313333333303113331113110313131113333 3313133113331311113111311331331111313133
SG406a33313311133111031113310103113111131133330313101011 1303111111131333113131333331133131333111
SG426b11331133331113331333131103311131133111331131331113 0113133110131133331110133331131133131113
SG442a11131133113131031333113131331131331331313331131111 3111333133131133331113313133313331111113
SG442b31113311133313113111313333133113111130111313333333 1311311333311133133131311313113113313331
UMC004b11111113133311333113133113133131311311311311131113 1131333103311313131313131333111113131113
UMC015b31303130333311311331013111131331013111131133111113 1331131111311111131313311131131113313133
UMC027a33111313311131333303013331113131133111333131133333 1133331333131331131113131131113133131311
UMC031a31333131333331311331013111133131113111131133111113 1331131111311111133313311131131113313133
UMC044a33311133311111013333303311313333333313113333333313 1333300111131311113333333113111313111313
UMC045a11313313313113131311031313311311311133131313311131 1113111333333311313113133130133311113333
UMC047a11131133113313113331033113333113333333111131311331 3311313113331331311331311131333331133111
UMC047b11311311113313333313011331113333113131111333331113 1113111311331133131111331313113313313313
UMC049a33103011313331133310011131311333113131113333131113 1111331131113113111331133133311313313310
UMC049b31103311113133331310013333313131311331313111331133 1133113333313130331333131313331113311330
UMC076b11103031110301111130013133111331333331310333131133 1131313131313131333113111133133313311311
UMC076c33101113133331131311033111133333131111113333111111 3331131111311133311301331111331133331133
UMC128a11133133313131033133111111111313331331111113331113 1133133333111133111331131311033133113311
UMC130a11311311313113111103013333333313131131111103131111 1133133313333303111111131113131133113113
UMC130b31333133313113331301031331333313131111331303133331 1131111331311131313313311111311113313313
UMC130c11133311331111313313011111111131331311113131311103 1111333131333313131111311113113333331331
UMC139a31111111113133313111113333313133331311113331131133 3331313133331113111331311311113113313311
UMC139b11111100133331133131113111311311311313111111311133 1111333133111313133313303130113311131113
UMC147a11133113313111333103131111111313033111111313311113 1133131333311113113331131313133331113311
UMC147b31301130011311111101131303131131111113331131331313 1131333111313113133111313330111131131131

[ Export mapping scores ]