Query (optional)   in Class  

GrainGenes Map Data Report: Diploid Oat, Cornell2

[ Printable Version ]  [ Submit comment/correction ]

Map Data
Diploid Oat, Cornell2
Map
Avena-Sorrells-A
[ Show all 7 ]
External Databases
Gramene
Species
Avena atlantica
Avena hirtula
Female Parent
Avena atlantica M66/3
Male Parent
Avena hirtula Cc7050-CAV4490
Type
Genetic
Map Units
cM (Kosambi)
Reference
ReferenceVan Deynze AE et al. (1995) Comparative mapping in grasses. Oat relationships Molecular and General Genetics 249:349-356.
ReferenceO'Donoughue LS et al. (1992) An RFLP-based linkage map of oats based on a cross between two diploid taxa (Avena atlantica x A. hirtula). Genome 35:765-771.
Contact
Sorrells, Mark E.
Remarks
The population consisted of 44 F2 derived F3 families from a cross between two A-genome diploid species. The individual linkage maps in this study were developed by placing markers at a LOD threshold of 2.0 using Mapmaker v3.0 (Lander et al. 1987) with the Kosambi mapping function.
Image
[ Hide all but 1 of 9 ]
Van Deynze, 1995 Fig. 1a
Van Deynze, 1995 Fig. 1b
Van Deynze, 1995 Fig. 1c
Van Deynze, 1995 Fig. 2a
Van Deynze, 1995 Fig. 2b
Van Deynze, 1995 Fig. 3a
Van Deynze, 1995 Fig. 3b
Van Deynze, 1995 Fig. 4a
Van Deynze, 1995 Fig. 4b
Locus
[ Hide all but 1 of 357 ]
Flo14444144144444144444444441444044444140044440
Xabc16411523222222222331113212233231322222123321323
Xbcd103041223211530121111112352224215511221213321134
Xbcd104752221122113122425141122221322211412333222113
Xbcd105922222333222333225253521223222200250021122233
Xbcd107223314122231221212213111121225121321221312211
Xbcd108722121253322123525331232113111321122111212220
Xbcd108844221212342232441231232413211321142111424442
Xbcd109422241122212112322231122132222321312333222113
Xbcd109521122122322221212232321252211321131113221231
Xbcd11021533222222232335212212233431422221153421332
Xbcd111923313122235241213212111121551121321435512211
Xbcd113055500555555535335555555533035055505553055335
Xbcd11414444144144444144440444001444440444111444441
Xbcd114255355553530555555555555535555533553335055533
Xbcd115023313122231221213212111121221121321221112211
Xbcd118441444104144110441414444140111144014444441444
Xbcd119421322504132151221552222235525133213331055233
Xbcd122622222333323333521213521223221511000000122433
Xbcd123021133222213242334212212223335005221113321232
Xbcd123444441144414114444441144144444440414440000114
Xbcd123712123211224521232213323532122122212514211231
Xbcd125021544222222535335212211233431455221153051332
Xbcd126125225122450041213231111221211121341115111251
Xbcd127821313113222151355131223332225425433230333131
Xbcd128023121253232322221223211222212223122222211512
Xbcd130252221101213112325231152132235351355030155113
Xbcd131122222333222333222223221223222211222231122233
Xbcd13421322223132121221113222232551133213331212230
Xbcd134023222322221001224413211121222145351421324311
Xbcd13514144411544441444414444444444144414444411440
Xbcd1355A22222333221344221253521524221511255221122233
Xbcd1355B22221213322133221232232113111321122111212221
Xbcd140523313155531521210413151121555535355045355511
Xbcd141312232122123222122322222221223322322121223221
Xbcd142122121233322123525342132121211321122111212421
Xbcd142714151132333523525312234551222321155110223401
Xbcd142831523255522225111112322223211151211251321132
Xbcd144923313122231221213213111121221121321221312211
Xbcd14722222233022343222224221222222211222231122230
Xbcd14922222444444333220223221223222211222220022033
Xbcd149521322214132121521012222232521133213331215233
Xbcd1523232322222135224413222221222221321221322321
Xbcd150255555333555333555550555553555555555535555533
Xbcd1532.121322212232151522112225532111322213331315133
Xbcd1532.255553553050555355535555355555555535553333555
Xbcd1549.122232222233222222322221222223311322221123222
Xbcd1549.222121223322123222332232113111321122111212221
Xbcd155541444144411441444114144441441441441444041144
Xbcd156221442142321221214245551221221151321211112221
Xbcd158814232105133000020310420441223352322110223021
Xbcd162532221122212112425231122133242322332333222113
Xbcd163132221122212112322231122133222322332333222113
Xbcd164314221132333223222312232221223341122111223411
Xbcd166121222122214451232215552331322221322333545523
Xbcd167044111444444444444444444141414441144111414440
Xbcd168244441144414114440441144144444441414444444104
Xbcd168621322214132151521112422232151133213335455403
Xbcd170044444144441441414444110441411141441111111440
Xbcd170721144252522531331212211233331222221124451332
Xbcd172724121223355523541345135114111351122111254445
Xbcd173412121132333223525312233521222321122111223411
Xbcd175031223221232121112113322223211132225213325142
Xbcd176532221122212512445231102133222325442440522513
Xbcd177922122334222343222222221213222225221545253240
Xbcd179652221111113112325031155122232301415333022113
Xbcd180244141444444144044444144141411441144111414441
Xbcd1819A41144411141141110114414444411144111114411144
Xbcd1819B55355553535555555555555535555533553335555533
Xbcd182331223221232121112113322523211132221213325522
Xbcd1829A31523211522121111112352523222122211211221132
Xbcd1829B12242155133122122315222221223322322111223221
Xbcd1829C52225122252552322031152132232321312333112113
Xbcd185631524211532121511112352553211121221213421132
Xbcd186032221122212112425231115500005021322333522113
Xbcd187123312422231221214213111121225121321221512211
Xbcd187212222333322333225253522323322321251233521233
Xbcd187441444444144111440414444141441144414444441444
Xbcd188231554111335223115113352554111145511254255124
Xbcd196423354122231221514213111121225121321221312211
Xbcd196512242122123522122322222221223322322121223221
Xbcd20033313122231221213213111121221121321225311210
Xbcd22121133222222232331012212233331322221113322110
Xbcd25021533224224232335212212233331422221153421332
Xbcd26341444414144141441114444444001144014440411044
XBCD26612223211522521232213423222122122212553211231
Xbcd34221122122322221212233321222211321131213221231
Xbcd34812123245231221232223123232122122213133211220
Xbcd34921222125112231221121111221321215215333220000
Xbcd35122225552522232221231233213211324225551224222
Xbcd38522221212122232221231233213211322222111222222
Xbcd38623313122231221213213111120521121341341311410
Xbcd40221353224312321453232411223224322224213322131
Xbcd421A22222333225433225253221223222211255231522233
Xbcd421B22221155212112425231155132222325312333522113
Xbcd44621233222213232333212212223334232221113422230
Xbcd450A12221132333523111311234221221321122111223211
Xbcd450B21323232313323313232211223323332222213424131
Xbcd450C44441144414114444441144144444441414444444114
Xbcd45423313142231221213213111121221521320221312211
Xbcd53922222333222333225253221223222211225231522233
Xbcd71923353122231221213213551121221121321440314411
Xbcd72121322254542111521112222232521133253335255243
Xbcd78222222333222333221253521223225211222231122233
Xbcd79955555553355533555535535553555355555555555555
Xbcd80812121132333223121212233521222321152111222210
Xbcd82014444140144444144444444441444444444140444441
Xbcd82821322252132121222112222232111133213331212230
Xbcd85021322254132151121112222232521133513431215233
Xbcd88022221122113222222121152221342212212333122110
Xbcd88152151144033023151315233551222325550550224451
Xbcd89545544444444444440452212233331422241123321332
Xbcd89623313122231241413213111121225141321441414211
Xbcd9212223211020001200013303222122000012000011201
Xbcd92622221214422232421231232213211321122111224422
Xbcd92721322213132121221112222232521124253330215233
Xbcd929A21122124422222212133321222211321131414555433
Xbcd929B52225122513122322141152221322211312333225113
Xbcd93855555333555033555553555553555555555535555533
Xbcd94121322212132121221112222232221123213331212233
Xbcd94412222132333123222312232221223321122115223411
Xbcd94624414155531221214212111121551121425221112211
Xbcd96112242151123422122325225551223322322121223221
Xbcd97812222211522521232213323222122124212112311431
Xbcd98141444000144111441414444141441144014444441444
Xbcd98A11144441140141441444144444144144414144411440
Xbcd98B22232331242333222223221223222221222231222230
Xcdo101512232122133222122311222221223322222111223221
Xcdo104911223222222232332113212233231322222123321323
Xcdo10525222112212231232011112331322021322333121123
Xcdo108121323222213232233230112323333322122213422230
Xcdo10922122122321201212232311212211221131113211231
Xcdo115831223221502141112113322223211132221213425142
Xcdo116021322214132121521112222235121133214331212240
Xcdo1173.123313222231221222213111121222122321221312211
Xcdo1173.244144144444141414444441414411441441114111441
Xcdo117421322214132121221112222232221123213331212233
Xcdo11821322212132141221415222242121133413341213330
Xcdo12212222135322523222312233221222321122111223211
Xcdo1241A21322213132521521112422232211333213331415533
Xcdo1241B42222333322433221213221223325321255231501433
Xcdo124621233042200030333222212323334432121213421232
Xcdo125321322213132121221112222232121133213331211233
Xcdo125552221155113122325521502221352255212333122113
Xcdo12755533555553535335555555533335355555553355330
Xcdo127122222333323333222223221223222221222231222233
Xcdo128121222111112231221121121221321211211333222113
Xcdo132831223212222521111114322223211121211212321130
Xcdo133521133222222232332212211233331322221123321332
Xcdo133815242125134222522352225111223322322111223221
Xcdo137312233122122232132222222231332222222121322331
Xcdo137822222333323333221213521223325321225231121533
Xcdo138022221122212112222231122132222321312333222113
Xcdo138721533222222232335213212233331422221123322330
Xcdo139521133222222232332212212233331332221113321232
Xcdo140121233222213232333222212223333432221113421232
Xcdo141655533000555500335055555533335355005553355335
Xcdo141712223211222121211112323223222122212251221230
Xcdo142121322213132111221312222232121133213331211233
Xcdo142323232332313100000000001133212425344221231331
Xcdo142521322213122121221112222232221123213331222233
Xcdo1428A22222333225333525553221223222211225235522233
Xcdo1428B22221122212112222231122132222322312333522113
Xcdo143521322214232555522112221535111325513331311133
Xcdo143641440044114441441041104441440411411444444114
Xcdo143921544222222232335212211233331322221123321332
Xcdo144512123211221221232223223232122122212213211231
Xcdo145122222333222333221223221223222111222231122233
Xcdo145455555033555333555553555553555555555535555533
Xcdo146221133222222232335212212233331422241123421332
Xcdo146622222333322333222223221223222211222221222233
Xcdo146722222333322433225253221223322321222231521233
Xcdo146950555530355553555355533555555355555555553055
Xcdo147333132332313133424232311133412225342231231331
Xcdo147514121132323223221312233221212321122115223421
Xcdo147921322554522111125114422235552103213330005033
Xcdo149522222125212201225125152521321211221333121123
Xcdo150221322212122111221212223231221123213333231232
Xcdo150514125134323223522312433221412321123111224441
Xcdo150822221510115500005045503213551332222555044111
Xcdo150921322513122111421552222232222123213333221233
Xcdo151323314122231521214213111121551121341241312211
Xcdo151621133222222232331212212233331422221143321332
Xcdo151923313155531221514210001151555121341005012201
Xcdo152321322214522111221512222232252523213333222233
Xcdo152522222333422333225223225223222255222231222233
Xcdo1527A21453553224522322235122332221005433431333535
Xcdo1527B21353222213232333235052323334432121513421232
Xcdo152821323222213242433231112424444332121213222230
Xcdo1722222333322333222223221223222211222221222233
Xcdo19631223221232121112113322223211132211213322122
Xcdo2021323222213232333231112323334332121213221232
Xcdo20222142122321221213242111221211121341111111221
Xcdo21224221213322144521232232213111321122111414422
Xcdo21621122122322222252133325232211321131412221233
Xcdo22023354122231221214213111121225121321441312211
Xcdo241.112122132333223222312232121213321122111223221
Xcdo241.212121132322223221312233121212321122111223221
Xcdo24412123121222221221113323222222122212221221230
Xcdo27022142122322241514245121222215141341111111221
Xcdo31223313122231221213213111121221131321221212211
Xcdo32821322213132121221112222232221133213331212230
Xcdo33712222132333223222212232241223321122111223211
Xcdo34122222333322333222223221223222211222221122233
Xcdo34421544222222232335212211233431422221123222330
Xcdo34522222122211431222112122221321211221333111123
Xcdo34622242122321221213222111221215121341111111421
Xcdo353A53555355555535553550555555555555355555355350
Xcdo353B41444414144141441414444444141444414441414440
Xcdo36531223211132121111112322223211121221213321132
Xcdo36A21322122122112232212223132222223213323231131
Xcdo36B14444144444444144414444141444441444111444440
Xcdo37312242125133222122311222225223322322111223251
Xcdo38531523211532521511512322223211121221213421132
Xcdo38A21533222222232331212212233431222221123422332
Xcdo38B22222122252331222522122221321211221333211123
Xcdo39322122122322221214245121221215141341111111220
Xcdo395a21122122322221212233321242211321131412221233
Xcdo395b31523211532121221012352523211121221213421132
Xcdo40022221212122233221232233213215332222111434222
Xcdo40722222333222343221253221223225211222231522233
Xcdo41222551212325132221232232213111351125115224225
Xcdo41423125254222422221223211222212223155222511222
Xcdo426A44414414441441414414111141441141441444401400
Xcdo426B55533353355553335555555533335355335553335350
Xcdo442A31322123231221213212111221221121341311212411
Xcdo442B12232121523522122342222221223321322111223221
Xcdo44712124241231221232223123232122122213033211221
Xcdo45522221125113112322231122122232325212333222110
Xcdo45612123221235221232223123232522222213133211221
Xcdo45712121232322223222312233121212321122111222220
Xcdo45955555555555535333555555533435355555553355330
Xcdo46021322214424121525142421333111321223331311143
Xcdo46512221130333153221312233551222321122115523311
Xcdo47041444444114444444114414444444444441114441444
Xcdo47621122214322251212232321222211321131113221230
Xcdo48221522255202231332321132331312225322533125103
Xcdo48422121233322223521042232521212325522151212221
Xcdo49722222122212112322231122132222322312333222113
Xcdo50412221132330223222312233221222321122111223311
Xcdo50732221122212112322231122133222322332333222110
Xcdo516A22222332222332222254221223222325222231221223
Xcdo516B22221122213112222231122132232325312333222113
Xcdo51711123222222232331113212233231322222123321323
Xcdo520a23313222231221222213111121222122321221312210
Xcdo520b12232122133222122322222221223322322111223220
Xcdo52441223221232121112113322223211131221213422120
Xcdo52752225122113112422541122144252321312333224113
Xcdo53431523211232121511112322223211131221213421130
Xcdo53912223211222121221113323222222122212221221232
Xcdo5421322213132521221112222232521123213330052233
Xcdo54121233222222232332212212233332322231113321232
Xcdo54212222132333223222352232221223321122111223211
Xcdo54532222303322230131213212323322321111232121133
Xcdo54921322213425121222112420532111322213331315133
Xcdo56423313122231221213213111121521141321441312211
Xcdo5722221212322232221231233213211321122111223422
Xcdo58023314555545525224213111121222125321421312211
Xcdo585A21322214132521521112222232551133213331212233
Xcdo585B53555553535355555555555335555553555555555555
Xcdo586A55355550535555555555555535555533553335555533
Xcdo586B55555333355333555553555353355355555535555533
Xcdo5932221122212112321231122133222323332333222223
Xcdo59023313122231221213212111121225121321221512210
Xcdo59522222333222333225223221223222211222231522230
Xcdo59823313122231221213213111121221121321221312211
Xcdo608A41444414144111441114444444444144414444444444
Xcdo608B44444144114441441141144441441411411444441144
Xcdo61823314222231221214213111121222122301421312211
Xcdo63821322213132121221112221232111323213331212133
Xcdo6421134444424434330252404233331322431123341334
Xcdo64523121222231312222212211332212213222222221212
Xcdo66521322214122111221112222232222123133332212330
Xcdo66731523121232121111112322223211121221211321130
Xcdo66912222122333223122312232221223321122111223211
Xcdo67622222333322333222223221223322321222231221233
Xcdo67831523251231121151212312223211121221213321130
Xcdo68012224211222221232213324222122122212553211241
Xcdo68655555533555333555553553553555555553533555355
Xcdo68921221102112231221021112221321200211333222113
Xcdo70812221132333223222312233221222321122111223311
Xcdo71823222322221131223213211121222122321221322321
Xcdo73522121253322133525235232113111321122111414421
Xcdo74921133002220232331212211233431422221153321332
Xcdo75812242121133222122311222521223322320111223421
Xcdo77232221155512112321231155133242321342333122113
Xcdo7822222333222343225250121223222221222231222230
Xcdo79512222122333222122312232221223321222111223221
Xcdo8223354122241221214213111121221121321421412211
Xcdo8712121132323223222312233221212321123111223211
Xcdo8955555553353354533555555555555553555553555550
Xcdo9121133222223232332212212223335345241114321030
Xcdo92041444441144141441414444444401144414441414444
Xcdo93821133224522242331212212233431222221123421330
Xcdo941A35553555555555555555555553555555555555455530
Xcdo941B21322213122111221112222232222123213333221203
Xcdo94241114111111111111011411114111111111111411141
Xcdo94831223221232121112113322223211131221213222122
Xcdo94943313122231221214213111121221141321441412211
Xcdo96222222333222333225223221223222221222231122233
Xcdo9800000000000000000000011141411141441441414411
Xcmwg649.155553555555555555555353553554555555555555535
Xcmwg649.241144411444140000004411104441140400000441144
Xcmwg67641444144141441414444111441441141441410414411
Xcmwg80023314524030000204213151121221121301020252211
Xcsu2512232115134222222312222221223322322111223221
XksuD14A44444444414144444444411144414441444441441441
XksuD14B14411144041114111141411114141114111111414411
XksuE1923112223222431421253211222212222332223112223
Xmwg645A53535335353535555033355533555305355555535330
Xmwg645B22121232343223121312232121213321122111213220
Xmwg6831333133332232223221212232222201331312221310
Xmwg73331322123241221213212111221221121321211512210
Xmwg93833233303353533244233311133311142222222431040
XNor31322123133151521112222233121133213331313330
Xrz14112232125133222122312222221223322222111223221
Xrz255555333355333555553555353355355555535555530
Xrz21300055500055000000000000500001411222334455550
Xrz24244414444444444445444441444444441444441044440
Xrz244A23353122231221213210152222222241321345311210
Xrz244B21322213132121221212222232521133213331212230
Xrz25121233222222232335212211233331222221123422102
Xrz26121133222222240235252211233331322222523221330
Xrz27332221122212112322231122133222322322333222113
Xrz387.141444411044441111111444444411111111114441140
Xrz387.255555555535555555553355553555555555553335550
Xrz39023232332313131223223311122222422322221321330
Xrz39514121132333523222312233111222321122111224210
Xrz39722222443222233222222031223222211222231122430
Xrz40011133245214535333222212323333332221112211232
Xrz40412222111333122122315232521223321222111223221
Xrz44421322123122111221112222232222123213331222230
Xrz44612221122113122222120515521312212412333522110
Xrz47631523211132121111113322223211131221212221132
Xrz50023313122235221212213111121221121321225311210
Xrz50823121223232312222212211332212223122222212210
Xrz51622222334422333221213222121122421225233221234
Xrz54311322250222121222122221333215322223331334130
Xrz57421122122424221215233321242211321131210525233
Xrz58323323132235225253223522225221141321322312220
Xrz59632221212522232321232233213211324242111322220
Xrz61222222333322343221212221223222211222221225230
Xrz61455555000050030030400035555555355555555555050
Xrz68223122223222322321223211222212223122222112220
Xrz6921322213122111221112222232222123213333221233
Xrz77621322202232222522113422232521143253331252233
Xrz8735223222232421111113352223211131221214451122
Xrz89223313122231221213213111121221121321221311210
Xrz95242222343322233242223221223222421222220522233
Xumn13321322213132121521112221532111323213331215133
Xumn16253535332313131523533311133212451325151211001
Xumn26754242122133222522355222521423322322111223421
Xwg11021552152215331232115152531451221221333521123
Xwg11421323222213230333231212323333335121003421232
Xwg42023121223222322221223211222212223122222211222
Xwg68622212233225333221253521223510001251533155323
XWG99641553111141121111512352523211155225253321132

[ Export mapping scores ]