Query (optional)   in Class  

GrainGenes Map Data Report: Diploid Oat, Cornell2

[ Printable Version ]  [ Submit comment/correction ]

Map Data
Diploid Oat, Cornell2
Map
[ Hide all but 1 of 7 ]
Avena-Sorrells-A
Avena-Sorrells-B
Avena-Sorrells-C
Avena-Sorrells-D
Avena-Sorrells-E
Avena-Sorrells-F
Avena-Sorrells-G
External Databases
Gramene
Species
Avena atlantica
Avena hirtula
Female Parent
Avena atlantica M66/3
Male Parent
Avena hirtula Cc7050-CAV4490
Type
Genetic
Map Units
cM (Kosambi)
Reference
ReferenceVan Deynze AE et al. (1995) Comparative mapping in grasses. Oat relationships Molecular and General Genetics 249:349-356.
ReferenceO'Donoughue LS et al. (1992) An RFLP-based linkage map of oats based on a cross between two diploid taxa (Avena atlantica x A. hirtula). Genome 35:765-771.
Contact
Sorrells, Mark E.
Remarks
The population consisted of 44 F2 derived F3 families from a cross between two A-genome diploid species. The individual linkage maps in this study were developed by placing markers at a LOD threshold of 2.0 using Mapmaker v3.0 (Lander et al. 1987) with the Kosambi mapping function.
Image
Van Deynze, 1995 Fig. 1a
[ Show all 9 ]
Locus
[ Hide all but 1 of 357 ]
Flo14444144144444144444444441444044444140044440
Xabc16411523222222222331113212233231322222123321323
Xbcd103041223211530121111112352224215511221213321134
Xbcd104752221122113122425141122221322211412333222113
Xbcd105922222333222333225253521223222200250021122233
Xbcd107223314122231221212213111121225121321221312211
Xbcd108722121253322123525331232113111321122111212220
Xbcd108844221212342232441231232413211321142111424442
Xbcd109422241122212112322231122132222321312333222113
Xbcd109521122122322221212232321252211321131113221231
Xbcd11021533222222232335212212233431422221153421332
Xbcd111923313122235241213212111121551121321435512211
Xbcd113055500555555535335555555533035055505553055335
Xbcd11414444144144444144440444001444440444111444441
Xbcd114255355553530555555555555535555533553335055533
Xbcd115023313122231221213212111121221121321221112211
Xbcd118441444104144110441414444140111144014444441444
Xbcd119421322504132151221552222235525133213331055233
Xbcd122622222333323333521213521223221511000000122433
Xbcd123021133222213242334212212223335005221113321232
Xbcd123444441144414114444441144144444440414440000114
Xbcd123712123211224521232213323532122122212514211231
Xbcd125021544222222535335212211233431455221153051332
Xbcd126125225122450041213231111221211121341115111251
Xbcd127821313113222151355131223332225425433230333131
Xbcd128023121253232322221223211222212223122222211512
Xbcd130252221101213112325231152132235351355030155113
Xbcd131122222333222333222223221223222211222231122233
Xbcd13421322223132121221113222232551133213331212230
Xbcd134023222322221001224413211121222145351421324311
Xbcd13514144411544441444414444444444144414444411440
Xbcd1355A22222333221344221253521524221511255221122233
Xbcd1355B22221213322133221232232113111321122111212221
Xbcd140523313155531521210413151121555535355045355511
Xbcd141312232122123222122322222221223322322121223221
Xbcd142122121233322123525342132121211321122111212421
Xbcd142714151132333523525312234551222321155110223401
Xbcd142831523255522225111112322223211151211251321132
Xbcd144923313122231221213213111121221121321221312211
Xbcd14722222233022343222224221222222211222231122230
Xbcd14922222444444333220223221223222211222220022033
Xbcd149521322214132121521012222232521133213331215233
Xbcd1523232322222135224413222221222221321221322321
Xbcd150255555333555333555550555553555555555535555533
Xbcd1532.121322212232151522112225532111322213331315133
Xbcd1532.255553553050555355535555355555555535553333555
Xbcd1549.122232222233222222322221222223311322221123222
Xbcd1549.222121223322123222332232113111321122111212221
Xbcd155541444144411441444114144441441441441444041144
Xbcd156221442142321221214245551221221151321211112221
Xbcd158814232105133000020310420441223352322110223021
Xbcd162532221122212112425231122133242322332333222113
Xbcd163132221122212112322231122133222322332333222113
Xbcd164314221132333223222312232221223341122111223411
Xbcd166121222122214451232215552331322221322333545523
Xbcd167044111444444444444444444141414441144111414440
Xbcd168244441144414114440441144144444441414444444104
Xbcd168621322214132151521112422232151133213335455403
Xbcd170044444144441441414444110441411141441111111440
Xbcd170721144252522531331212211233331222221124451332
Xbcd172724121223355523541345135114111351122111254445
Xbcd173412121132333223525312233521222321122111223411
Xbcd175031223221232121112113322223211132225213325142
Xbcd176532221122212512445231102133222325442440522513
Xbcd177922122334222343222222221213222225221545253240
Xbcd179652221111113112325031155122232301415333022113
Xbcd180244141444444144044444144141411441144111414441
Xbcd1819A41144411141141110114414444411144111114411144
Xbcd1819B55355553535555555555555535555533553335555533
Xbcd182331223221232121112113322523211132221213325522
Xbcd1829A31523211522121111112352523222122211211221132
Xbcd1829B12242155133122122315222221223322322111223221
Xbcd1829C52225122252552322031152132232321312333112113
Xbcd185631524211532121511112352553211121221213421132
Xbcd186032221122212112425231115500005021322333522113
Xbcd187123312422231221214213111121225121321221512211
Xbcd187212222333322333225253522323322321251233521233
Xbcd187441444444144111440414444141441144414444441444
Xbcd188231554111335223115113352554111145511254255124
Xbcd196423354122231221514213111121225121321221312211
Xbcd196512242122123522122322222221223322322121223221
Xbcd20033313122231221213213111121221121321225311210
Xbcd22121133222222232331012212233331322221113322110
Xbcd25021533224224232335212212233331422221153421332
Xbcd26341444414144141441114444444001144014440411044
XBCD26612223211522521232213423222122122212553211231
Xbcd34221122122322221212233321222211321131213221231
Xbcd34812123245231221232223123232122122213133211220
Xbcd34921222125112231221121111221321215215333220000
Xbcd35122225552522232221231233213211324225551224222
Xbcd38522221212122232221231233213211322222111222222
Xbcd38623313122231221213213111120521121341341311410
Xbcd40221353224312321453232411223224322224213322131
Xbcd421A22222333225433225253221223222211255231522233
Xbcd421B22221155212112425231155132222325312333522113
Xbcd44621233222213232333212212223334232221113422230
Xbcd450A12221132333523111311234221221321122111223211
Xbcd450B21323232313323313232211223323332222213424131
Xbcd450C44441144414114444441144144444441414444444114
Xbcd45423313142231221213213111121221521320221312211
Xbcd53922222333222333225253221223222211225231522233
Xbcd71923353122231221213213551121221121321440314411
Xbcd72121322254542111521112222232521133253335255243
Xbcd78222222333222333221253521223225211222231122233
Xbcd79955555553355533555535535553555355555555555555
Xbcd80812121132333223121212233521222321152111222210
Xbcd82014444140144444144444444441444444444140444441
Xbcd82821322252132121222112222232111133213331212230
Xbcd85021322254132151121112222232521133513431215233
Xbcd88022221122113222222121152221342212212333122110
Xbcd88152151144033023151315233551222325550550224451
Xbcd89545544444444444440452212233331422241123321332
Xbcd89623313122231241413213111121225141321441414211
Xbcd9212223211020001200013303222122000012000011201
Xbcd92622221214422232421231232213211321122111224422
Xbcd92721322213132121221112222232521124253330215233
Xbcd929A21122124422222212133321222211321131414555433
Xbcd929B52225122513122322141152221322211312333225113
Xbcd93855555333555033555553555553555555555535555533
Xbcd94121322212132121221112222232221123213331212233
Xbcd94412222132333123222312232221223321122115223411
Xbcd94624414155531221214212111121551121425221112211
Xbcd96112242151123422122325225551223322322121223221
Xbcd97812222211522521232213323222122124212112311431
Xbcd98141444000144111441414444141441144014444441444
Xbcd98A11144441140141441444144444144144414144411440
Xbcd98B22232331242333222223221223222221222231222230
Xcdo101512232122133222122311222221223322222111223221
Xcdo104911223222222232332113212233231322222123321323
Xcdo10525222112212231232011112331322021322333121123
Xcdo108121323222213232233230112323333322122213422230
Xcdo10922122122321201212232311212211221131113211231
Xcdo115831223221502141112113322223211132221213425142
Xcdo116021322214132121521112222235121133214331212240
Xcdo1173.123313222231221222213111121222122321221312211
Xcdo1173.244144144444141414444441414411441441114111441
Xcdo117421322214132121221112222232221123213331212233
Xcdo11821322212132141221415222242121133413341213330
Xcdo12212222135322523222312233221222321122111223211
Xcdo1241A21322213132521521112422232211333213331415533
Xcdo1241B42222333322433221213221223325321255231501433
Xcdo124621233042200030333222212323334432121213421232
Xcdo125321322213132121221112222232121133213331211233
Xcdo125552221155113122325521502221352255212333122113
Xcdo12755533555553535335555555533335355555553355330
Xcdo127122222333323333222223221223222221222231222233
Xcdo128121222111112231221121121221321211211333222113
Xcdo132831223212222521111114322223211121211212321130
Xcdo133521133222222232332212211233331322221123321332
Xcdo133815242125134222522352225111223322322111223221
Xcdo137312233122122232132222222231332222222121322331
Xcdo137822222333323333221213521223325321225231121533
Xcdo138022221122212112222231122132222321312333222113
Xcdo138721533222222232335213212233331422221123322330
Xcdo139521133222222232332212212233331332221113321232
Xcdo140121233222213232333222212223333432221113421232
Xcdo141655533000555500335055555533335355005553355335
Xcdo141712223211222121211112323223222122212251221230
Xcdo142121322213132111221312222232121133213331211233
Xcdo142323232332313100000000001133212425344221231331
Xcdo142521322213122121221112222232221123213331222233
Xcdo1428A22222333225333525553221223222211225235522233
Xcdo1428B22221122212112222231122132222322312333522113
Xcdo143521322214232555522112221535111325513331311133
Xcdo143641440044114441441041104441440411411444444114
Xcdo143921544222222232335212211233331322221123321332
Xcdo144512123211221221232223223232122122212213211231
Xcdo145122222333222333221223221223222111222231122233
Xcdo145455555033555333555553555553555555555535555533
Xcdo146221133222222232335212212233331422241123421332
Xcdo146622222333322333222223221223222211222221222233
Xcdo146722222333322433225253221223322321222231521233
Xcdo146950555530355553555355533555555355555555553055
Xcdo147333132332313133424232311133412225342231231331
Xcdo147514121132323223221312233221212321122115223421
Xcdo147921322554522111125114422235552103213330005033
Xcdo149522222125212201225125152521321211221333121123
Xcdo150221322212122111221212223231221123213333231232
Xcdo150514125134323223522312433221412321123111224441
Xcdo150822221510115500005045503213551332222555044111
Xcdo150921322513122111421552222232222123213333221233
Xcdo151323314122231521214213111121551121341241312211
Xcdo151621133222222232331212212233331422221143321332
Xcdo151923313155531221514210001151555121341005012201
Xcdo152321322214522111221512222232252523213333222233
Xcdo152522222333422333225223225223222255222231222233
Xcdo1527A21453553224522322235122332221005433431333535
Xcdo1527B21353222213232333235052323334432121513421232
Xcdo152821323222213242433231112424444332121213222230
Xcdo1722222333322333222223221223222211222221222233
Xcdo19631223221232121112113322223211132211213322122
Xcdo2021323222213232333231112323334332121213221232
Xcdo20222142122321221213242111221211121341111111221
Xcdo21224221213322144521232232213111321122111414422
Xcdo21621122122322222252133325232211321131412221233
Xcdo22023354122231221214213111121225121321441312211
Xcdo241.112122132333223222312232121213321122111223221
Xcdo241.212121132322223221312233121212321122111223221
Xcdo24412123121222221221113323222222122212221221230
Xcdo27022142122322241514245121222215141341111111221
Xcdo31223313122231221213213111121221131321221212211
Xcdo32821322213132121221112222232221133213331212230
Xcdo33712222132333223222212232241223321122111223211
Xcdo34122222333322333222223221223222211222221122233
Xcdo34421544222222232335212211233431422221123222330
Xcdo34522222122211431222112122221321211221333111123
Xcdo34622242122321221213222111221215121341111111421
Xcdo353A53555355555535553550555555555555355555355350
Xcdo353B41444414144141441414444444141444414441414440
Xcdo36531223211132121111112322223211121221213321132
Xcdo36A21322122122112232212223132222223213323231131
Xcdo36B14444144444444144414444141444441444111444440
Xcdo37312242125133222122311222225223322322111223251
Xcdo38531523211532521511512322223211121221213421132
Xcdo38A21533222222232331212212233431222221123422332
Xcdo38B22222122252331222522122221321211221333211123
Xcdo39322122122322221214245121221215141341111111220
Xcdo395a21122122322221212233321242211321131412221233
Xcdo395b31523211532121221012352523211121221213421132
Xcdo40022221212122233221232233213215332222111434222
Xcdo40722222333222343221253221223225211222231522233
Xcdo41222551212325132221232232213111351125115224225
Xcdo41423125254222422221223211222212223155222511222
Xcdo426A44414414441441414414111141441141441444401400
Xcdo426B55533353355553335555555533335355335553335350
Xcdo442A31322123231221213212111221221121341311212411
Xcdo442B12232121523522122342222221223321322111223221
Xcdo44712124241231221232223123232122122213033211221
Xcdo45522221125113112322231122122232325212333222110
Xcdo45612123221235221232223123232522222213133211221
Xcdo45712121232322223222312233121212321122111222220
Xcdo45955555555555535333555555533435355555553355330
Xcdo46021322214424121525142421333111321223331311143
Xcdo46512221130333153221312233551222321122115523311
Xcdo47041444444114444444114414444444444441114441444
Xcdo47621122214322251212232321222211321131113221230
Xcdo48221522255202231332321132331312225322533125103
Xcdo48422121233322223521042232521212325522151212221
Xcdo49722222122212112322231122132222322312333222113
Xcdo50412221132330223222312233221222321122111223311
Xcdo50732221122212112322231122133222322332333222110
Xcdo516A22222332222332222254221223222325222231221223
Xcdo516B22221122213112222231122132232325312333222113
Xcdo51711123222222232331113212233231322222123321323
Xcdo520a23313222231221222213111121222122321221312210
Xcdo520b12232122133222122322222221223322322111223220
Xcdo52441223221232121112113322223211131221213422120
Xcdo52752225122113112422541122144252321312333224113
Xcdo53431523211232121511112322223211131221213421130
Xcdo53912223211222121221113323222222122212221221232
Xcdo5421322213132521221112222232521123213330052233
Xcdo54121233222222232332212212233332322231113321232
Xcdo54212222132333223222352232221223321122111223211
Xcdo54532222303322230131213212323322321111232121133
Xcdo54921322213425121222112420532111322213331315133
Xcdo56423313122231221213213111121521141321441312211
Xcdo5722221212322232221231233213211321122111223422
Xcdo58023314555545525224213111121222125321421312211
Xcdo585A21322214132521521112222232551133213331212233
Xcdo585B53555553535355555555555335555553555555555555
Xcdo586A55355550535555555555555535555533553335555533
Xcdo586B55555333355333555553555353355355555535555533
Xcdo5932221122212112321231122133222323332333222223
Xcdo59023313122231221213212111121225121321221512210
Xcdo59522222333222333225223221223222211222231522230
Xcdo59823313122231221213213111121221121321221312211
Xcdo608A41444414144111441114444444444144414444444444
Xcdo608B44444144114441441141144441441411411444441144
Xcdo61823314222231221214213111121222122301421312211
Xcdo63821322213132121221112221232111323213331212133
Xcdo6421134444424434330252404233331322431123341334
Xcdo64523121222231312222212211332212213222222221212
Xcdo66521322214122111221112222232222123133332212330
Xcdo66731523121232121111112322223211121221211321130
Xcdo66912222122333223122312232221223321122111223211
Xcdo67622222333322333222223221223322321222231221233
Xcdo67831523251231121151212312223211121221213321130
Xcdo68012224211222221232213324222122122212553211241
Xcdo68655555533555333555553553553555555553533555355
Xcdo68921221102112231221021112221321200211333222113
Xcdo70812221132333223222312233221222321122111223311
Xcdo71823222322221131223213211121222122321221322321
Xcdo73522121253322133525235232113111321122111414421
Xcdo74921133002220232331212211233431422221153321332
Xcdo75812242121133222122311222521223322320111223421
Xcdo77232221155512112321231155133242321342333122113
Xcdo7822222333222343225250121223222221222231222230
Xcdo79512222122333222122312232221223321222111223221
Xcdo8223354122241221214213111121221121321421412211
Xcdo8712121132323223222312233221212321123111223211
Xcdo8955555553353354533555555555555553555553555550
Xcdo9121133222223232332212212223335345241114321030
Xcdo92041444441144141441414444444401144414441414444
Xcdo93821133224522242331212212233431222221123421330
Xcdo941A35553555555555555555555553555555555555455530
Xcdo941B21322213122111221112222232222123213333221203
Xcdo94241114111111111111011411114111111111111411141
Xcdo94831223221232121112113322223211131221213222122
Xcdo94943313122231221214213111121221141321441412211
Xcdo96222222333222333225223221223222221222231122233
Xcdo9800000000000000000000011141411141441441414411
Xcmwg649.155553555555555555555353553554555555555555535
Xcmwg649.241144411444140000004411104441140400000441144
Xcmwg67641444144141441414444111441441141441410414411
Xcmwg80023314524030000204213151121221121301020252211
Xcsu2512232115134222222312222221223322322111223221
XksuD14A44444444414144444444411144414441444441441441
XksuD14B14411144041114111141411114141114111111414411
XksuE1923112223222431421253211222212222332223112223
Xmwg645A53535335353535555033355533555305355555535330
Xmwg645B22121232343223121312232121213321122111213220
Xmwg6831333133332232223221212232222201331312221310
Xmwg73331322123241221213212111221221121321211512210
Xmwg93833233303353533244233311133311142222222431040
XNor31322123133151521112222233121133213331313330
Xrz14112232125133222122312222221223322222111223221
Xrz255555333355333555553555353355355555535555530
Xrz21300055500055000000000000500001411222334455550
Xrz24244414444444444445444441444444441444441044440
Xrz244A23353122231221213210152222222241321345311210
Xrz244B21322213132121221212222232521133213331212230
Xrz25121233222222232335212211233331222221123422102
Xrz26121133222222240235252211233331322222523221330
Xrz27332221122212112322231122133222322322333222113
Xrz387.141444411044441111111444444411111111114441140
Xrz387.255555555535555555553355553555555555553335550
Xrz39023232332313131223223311122222422322221321330
Xrz39514121132333523222312233111222321122111224210
Xrz39722222443222233222222031223222211222231122430
Xrz40011133245214535333222212323333332221112211232
Xrz40412222111333122122315232521223321222111223221
Xrz44421322123122111221112222232222123213331222230
Xrz44612221122113122222120515521312212412333522110
Xrz47631523211132121111113322223211131221212221132
Xrz50023313122235221212213111121221121321225311210
Xrz50823121223232312222212211332212223122222212210
Xrz51622222334422333221213222121122421225233221234
Xrz54311322250222121222122221333215322223331334130
Xrz57421122122424221215233321242211321131210525233
Xrz58323323132235225253223522225221141321322312220
Xrz59632221212522232321232233213211324242111322220
Xrz61222222333322343221212221223222211222221225230
Xrz61455555000050030030400035555555355555555555050
Xrz68223122223222322321223211222212223122222112220
Xrz6921322213122111221112222232222123213333221233
Xrz77621322202232222522113422232521143253331252233
Xrz8735223222232421111113352223211131221214451122
Xrz89223313122231221213213111121221121321221311210
Xrz95242222343322233242223221223222421222220522233
Xumn13321322213132121521112221532111323213331215133
Xumn16253535332313131523533311133212451325151211001
Xumn26754242122133222522355222521423322322111223421
Xwg11021552152215331232115152531451221221333521123
Xwg11421323222213230333231212323333335121003421232
Xwg42023121223222322221223211222212223122222211222
Xwg68622212233225333221253521223510001251533155323
XWG99641553111141121111512352523211155225253321132

[ Export mapping scores ]