Query (optional)   in Class  

GrainGenes Map Data Report: Oat, CxI

[ Printable Version ]  [ Submit comment/correction ]

Map Data
Oat, CxI
Map
Oat-CxI-1
[ Show all 30 ]
Species
Avena sativa
Female Parent
Clintland 64 CIav7639
Male Parent
IL86-5698 (oat)
Type
Genetic
Map Units
cM (Kosambi)
Reference
ReferenceJin H et al. (2000) Combined AFLP and RFLP mapping in two hexaploid oat recombinant inbred populations Genome 94-101.
Remarks
An AFLP linkage map was constructed using 126 recombinant inbred lines from a cross between two hexaploid oats, 'Clintland64' (BYDV sensitive) and 'IL86-5698' (BYDV tolerant).
26 primer combinations were used for AFLP analysis, resulting in 193 loci mapped to unique positions, 73 mapped to intervals, 8 assigned to linkage groups, and 44 unlinked markers.
AFLP locus names indicate the primers used and the band scored, numbering the polymorphic bands upward from the smallest.
Loci with 'n' suffixes were associated with tolerance or sensitivity to BYDV in at least one pair of near-isogenic lines (NILs). See GrainGenes reference PHY-88-410, by Jin et al.
Data Curator
Hane, David
Carollo, Victoria
Image
Oat CxI 1-15
Oat CxI 16-30
Locus
[ Hide all but 1 of 264 ]
e1m2-2
e1m2-3b
e1m3-1
e1m3-10
e1m3-11
e1m3-12n
e1m3-14
e1m3-2
e1m3-3
e1m3-4
e1m3-4a
e1m3-5
e1m3-6
e1m3-6an
e1m3-7
e1m3-8
e1m3-9
e1m6-1
e1m6-10n
e1m6-11
e1m6-13
e1m6-14
e1m6-14a
e1m6-15
e1m6-15a
e1m6-16n
e1m6-2
e1m6-3
e1m6-5n
e1m6-6
e1m6-7
e1m6-8
e1m6-9
E1M6-9a
e1m8-1a
e1m8-2
e1m8-3n
e1m8-4
e1m8-4a
e1m8-5
e1m8-6
e1m8-7
e1m8-8
e2m2-11
e2m2-12
e2m2-15
e2m2-1b
e2m2-1d
e2m2-1e
e2m2-1f
e2m2-1g
e2m2-3
e2m2-4
e2m2-5
e2m2-5a
e2m2-6
e2m2-7
e2m2-8
e2m3-1
e2m3-10
e2m3-12
e2m3-12a
e2m3-2a
e2m3-2n
e2m3-3
e2m3-4n
e2m3-5
e2m3-5a
e2m3-6n
e2m3-7
e2m3-8aA
e2m3-8aB
e2m3-8C
e2m3-9
e3m3-10
e3m3-11
e3m3-12
e3m3-13
e3m3-15
e3m3-16
e3m3-17
e3m5-1
e3m5-11A
E3M5-11b
e3m5-13
e3m5-3
e3m5-4n
e3m5-5
e3m5-6
e3m5-6a
e3m5-7
e3m5-8
e3m5-9
e3m7-1
e3m7-1a
e3m7-2
e3m7-3n
e3m7-4
e3m7-5
e3m7-6
e3m7-7
e3m7-7a
e4m2-1a
e4m2-1b
e4m2-1c
e4m2-1e
e4m2-1fn
e4m2-2
e4m2-2a
e4m2-4
e4m2-5
e4m6-1
e4m6-1a
e4m6-3
e4m6-6a
e4m6-7
e4m6-8
e4m6-9n
e4m7-1
e4m7-1a
e4m7-2
e4m7-3
e4m7-4
e4m8-1
e4m8-1a
e4m8-2
e4m8-3
e4m8-4
e4m8-5
e5m1-1
e5m1-11n
e5m1-13n
e5m1-2n
e5m1-6n
e5m1-7
e5m1-9n
e5m5-1
e5m5-10
e5m5-10an
e5m5-11
e5m5-3
e5m5-4
e5m5-5
e5m5-6
e5m5-7
e5m5-8
e5m5-9
e5m7-10
e5m7-11
e5m7-4
e5m7-5
e5m7-6
e5m7-8
e5m7-9n
e6m4-1a
e6m4-1c
e6m4-2
e6m4-2an
e6m4-2b
e6m4-3
e6m4-3a
e6m4-3b
e6m4-4
e6m4-4a
e6m4-5
e6m4-6n
e6m4-7
e6m5-10n
e6m5-11
e6m5-1a
e6m5-1n
e6m5-2
e6m5-3aA
e6m5-3aB
e6m5-5
e6m5-5a
e6m5-6n
e6m5-7
e6m5-7a
e6m5-8n
e6m5-9
e6m6-10n
e6m6-11
e6m6-12
e6m6-13
e6m6-14a
e6m6-17
e6m6-18a
e6m6-19
e6m6-1n
e6m6-20n
e6m6-2n
e6m6-3n
e6m6-4a
e6m6-4n
e6m6-5
e6m6-6n
e6m6-7
e6m6-8
e6m6-9
e7m2-2
e7m2-3
e7m2-4
e7m2-5
e7m2-6
e7m2-7
e7m2-7a
e7m2-7c
e8m1-1
e8m1-13
e8m1-3
e8m1-4
e8m1-6
e8m1-7n
e8m1-8
e8m1-9n
e8m3-1
e8m3-10
e8m3-13
e8m3-14
e8m3-15
e8m3-16
e8m3-17n
e8m3-1n
e8m3-2
e8m3-3
e8m3-4
e8m3-5n
e8m3-6n
e8m3-7
e8m3-9
e8m8-1
e8m8-2n
e8m8-3
e8m8-4n
e8m8-5
e8m8-6
e8m8-8
e8m8-9
e9m5-1
e9m5-10
e9m5-10b
e9m5-11
e9m5-12
e9m5-13
e9m5-14a
e9m5-15
e9m5-16
e9m5-2a
e9m5-2b
e9m5-2n
e9m5-3
e9m5-4
e9m5-5n
e9m5-6
e9m5-7
e9m5-7b
e9m5-8
e9m5-9n
e9m6-1a
e9m6-1n
e9m6-2
e9m6-3a
e9m6-4